[发明专利]分子标记法检测水稻温敏雄性不育tms9-1基因的方法在审
申请号: | 201510227349.3 | 申请日: | 2015-05-06 |
公开(公告)号: | CN104818332A | 公开(公告)日: | 2015-08-05 |
发明(设计)人: | 祁永斌;金庆生;刘庆龙 | 申请(专利权)人: | 浙江省农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 杭州丰禾专利事务所有限公司 33214 | 代理人: | 王从友 |
地址: | 310021 *** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 分子 标记 检测 水稻 雄性不育 tms9 基因 方法 | ||
1.分子标记法检测水稻温敏雄性不育tms9-1基因的方法,其特征在于该方法包括以下的步骤:
1)提取待测样品的DNA, 采用分子标记QY-1进行PCR扩增,分子标记QY-1的引物对为:QY-1F:5′-GTGGACACGGCGAGGAAGGGCCAC-3′;QY-1R:5′-CGAGCATGAAGCGGAGGAGGTCCCCG-3′;PCR扩增条件为95℃预变性3min、95℃变性30 sec、60℃退火30 sec、72℃延伸30 sec,共35个循环,最后72℃延伸5 min;
2)PCR反应产物用于Sma1酶切反应,酶切方法为:PCR反应产物10μl、Sma1限制性内切酶0.5μl,浓度为1 U/μl、10×FastDigest buffer 2μl,去离子水7.5μl,酶切反应在30℃水浴锅中温浴20 min,加入4μl 6×loading buffer后于3%琼脂糖凝胶120U电压电泳30 min,在Tanon2500凝胶成像仪进行拍照;
3)待测DNA样品经过PCR扩增和Sma1酶切后,电泳方式能检测出259bp片段的含tms9-1基因的水稻材料,而片段大小为286bp的则是无tms9-1基因的水稻材料。
2.根据权利要求1所述的分子标记法检测水稻温敏雄性不育tms9-1基因的方法,其特征在于待测样品的DNA的提取方法如下:
1)取2 cm长的水稻叶片放入2 ml离心管中,加入液氮后将水稻叶片磨碎,再加入500 μl 2%的CTAB提取液,CTAB: 2 g,放于75℃水浴30 min ;100 ml CTAB提取液包括以下的组分:1 mol/L Tris-Hcl pH8.0 10 ml; 0.5 mol/L EDTA pH8.0 4 ml; Nacl: 8.12 g;
2)加入等体积氯仿/异戊醇充分振荡后,氯仿/异戊醇的体积比为24:1,放入离心机中12,000 rpm离心10 min,静止5 min后吸取500 μl 上清液于1.5 ml离心管;
3)加入等体积预冷的异丙醇后上下混匀,放入离心机中12,000 rpm离心10 min;
4)弃上清液并加入500 μl 70%的乙醇进行洗涤;12,000 rpm离心5min弃上清液后可见DNA的白色沉淀;
5)室温干燥10-20 min后,加入500 μl 去离子水溶解。
3.一种与水稻温敏雄性不育tms9-1基因完全连锁的dCAPS分子标记QY-1,其特征在于,该分子标记的引物对为:QY-1F:5′-GTGGACACGGCGAGGAAGGGCCAC-3′;QY-1R:5′-CGAGCATGAAGCGGAGGAGGTCCCCG-3′。
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