[发明专利]一种氟烷基因的分子标记辅助选择方法

权利要求书

1.一种氟烷基因的分子标记辅助选择方法，其特征在于，包括以下步骤：

1)、对现有群体的氟烷基因的基因型进行检测，对基因频率进行分析；

2)、利用R软件进行bootstrap、拟合直线、和作图分析，确定现有群体的氟烷基因的适宜频率；

3)、制定适宜的分子标记辅助选择育种方案；

4)、对育种后的氟烷基因频率进行监控。

2.根据权利要求1所述的氟烷基因的分子标记辅助选择方法，其特征在于，所述步骤1)为：利用PCR-RFLP的方法检测现有群体的氟烷基因，利用plink软件对基因型结果进行基因变异程度分析，若最小等位基因频率MAF>0.05，进行分子标记辅助选择。

3.根据权利要求1所述的氟烷基因的分子标记辅助选择方法，其特征在于，步骤2)中，所述bootstrap分析的步骤为：每次随机抽取50％样本，计算氟烷基因频率和表型平均值，通过1万次的随机抽样，得到1万个基因频率值和表型平均值数据。

4.根据权利要求1所述的氟烷基因的分子标记辅助选择方法，其特征在于，步骤2)中，所述拟合直线分析的步骤为：基于bootstrap生成的数据，利用线性模型，拟合基因型值和表型值，得到基因频率和表型值对应关系的拟合直线。

5.根据权利要求1所述的氟烷基因的分子标记辅助选择方法，其特征在于，步骤2)中，所述现有群体的氟烷基因的适宜频率是通过以下方法确定的：绘制基因频率对性状值效应相反的两类主选性状的拟合直线，两条直线交点对应的氟烷基因频率，即为适宜频率。

6.根据权利要求1所述的氟烷基因的分子标记辅助选择方法，其特征在于，所述步骤3)为：获得适宜频率后，根据现有群体的氟烷基因的遗传变异情况以及选育目标，制定适宜的氟烷基因分子标记选择育种方案，使群体尽快达到适宜频率。

7.根据权利要求1所述的氟烷基因的分子标记辅助选择方法，其特征在于，所述步骤4)为：现有群体达到适宜频率目标后，实时监控核心群的频率，选留的后备猪都需经过氟烷基因的检测，若群体频率不在适宜频率内，则需要再次进行群体优化。