[发明专利]用于樱桃病毒检测的多重RT‑PCR试剂盒及检测方法有效
申请号: | 201510280319.9 | 申请日: | 2015-05-27 |
公开(公告)号: | CN104831000B | 公开(公告)日: | 2017-08-11 |
发明(设计)人: | 卢美光;李世访;高蕊;张志想;吴冰 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院植物保护研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京海虹嘉诚知识产权代理有限公司11129 | 代理人: | 吴泳历 |
地址: | 100193 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 樱桃 病毒 检测 多重 rt pcr 试剂盒 方法 | ||
技术领域
本发明涉及植物病毒检测领域,具体涉及用于樱桃病毒检测的多重RT-PCR试剂盒及检测方法。
背景技术
由于栽培樱桃有较高经济效益,近几年樱桃的栽培在我国各地发展较快。我国的大樱桃栽培主要集中在山东的烟台,辽宁的大连,河北的秦皇岛等地,目前北京、山西、江苏、安徽、河南、甘肃、新疆等地均有栽培种植。但近年来,病毒病呈日益加重的趋势,成为影响樱桃产量和品质的重要因素。据国外报道,侵染大樱桃的病毒约有30多种,比较常见的大樱桃病毒主要有20种。我国已报道的侵染樱桃的主要病毒有:李属坏死环斑病毒(Prunus necrotic ringspot virus,PNRSV),李矮缩病毒(Prune dwarf virus,PDV),樱桃病毒A(Cherry virus A,CVA),樱桃绿环斑驳病毒(Cherry green ring mottle virus,CGRMV),樱桃小果病毒-2(Little cherry virus-2,LChV-2),樱桃小果病毒-1(Little cherry virus-1,LChV-1),苹果褪绿叶斑病毒(Apple chlorotic leafspot virus,ACLSV)等。
发明人在2014年4-10月对我国山东,辽宁和北京樱桃园的35个样品病毒进了常规的RT-PCR检测,结果表明CVA与CGRMV,CGRMV与LChV-1,CVA与ACLSV,CGRMV,LChV-1存在复合侵染现象(部分结果已发表在卢美光,吴冰,高蕊,等.我国部分地区樱桃病毒病害初步调查和病原检测.植物保护,2015,41(1):98-103.),未检测到CNRMV。有必要研究可以同时鉴别检测这四种樱桃病毒的快速检测手段。
关于樱桃病毒检测的现有技术,目前国内外已有3篇关于樱桃病毒多重RT-PCR报道,包括同时检测樱桃CVA,PNRSV,CNRMV,LChV-1四种病毒,同时检测樱桃PNRSV,PDV,LChV-2,CGRMV四种病毒和同时检测樱桃PNRSV,PDV,LChV-2三种病毒的报道,其中对CVA,PNRSV,CNRMV,LChV-1四种病毒的多重RT-PCR的报道是基于室内对四种病毒人工混合进行的研究,没有这四种病毒混合感染的田间样品。
RT-PCR检测方法是樱桃病毒检测的重要和常用的技术。多重RT-PCR(Multiplex RT-PCR,mRT-PCR)是PCR技术的发展,是对两个以上不同病毒基因位点的同时扩增,是一种较为快速、简便、经济的检测方法,目前,已应用到多种植物病毒的检测。该方法用于樱桃病毒复合感染的样品的检测是一种不错的选择。但对不同植物不同病毒组合的mRT-PCR检测体系均各不相同,必须对引物进行筛选,对引物浓度,样品cDNA浓度及PCR体系进行优化才能建立一套同时扩增多病毒基因的稳定的检测方法。
发明内容
根据上述领域存在的不足,本发明提供一种可同时检测侵染樱桃的CVA,ACLSV,CGRMV,LChV-1四种病毒的多重RT-PCR检测方法及其试剂盒。本发明请求保护的技术方案如下:
用于检测樱桃病毒的多重PCR试剂盒,其特征在于:包含独立包装或者混装在一起的如下的四对引物:
CVA-F:5’-TGTTGGGGCACAGTTTCAAG-3’,
CVA-R:5’-TGATTGGTGACGGTGAAGGA-3’;
ACLSV-F:5’-TCTGCAAGAGAATTTCAGTT-3’,
ACLSV-R:5’-GTCTACAGGCTATTTATTATAAG-3’;
CGRMV-F:5’-AGGCTAGGAATGGGATCAGC-3’,
CGRMV-R:5’-GTAACTTTAGCTTCGCCCCG-3’;
LChV-1F:5’-GGTTGTCCTCGGTTGATTAC-3’,
LChV-1R:5’-GGCTTGGTTCCATACACTTC-3’。
所述樱桃病毒为CVA,ACLSV,CGRMV和/或LChV-1。
所述多重PCR试剂盒,其特征在于:包含混装在一起的所述四对引物,四对引物的摩尔比为:CVA:ACLSV:CGRMV:LChV-1=1:11.25:0.5:10。
用于检测樱桃病毒CVA的PCR试剂盒,其特征在于:包含具有如下核苷酸序列的引物:
CVA-F:5’-TGTTGGGGCACAGTTTCAAG-3’,
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