[发明专利]人类BRAF基因V600E突变检测试剂盒有效
申请号: | 201510295442.8 | 申请日: | 2015-06-02 |
公开(公告)号: | CN105039514A | 公开(公告)日: | 2015-11-11 |
发明(设计)人: | 周鹏飞;蔡从利;张喆;叶婷;张浩 | 申请(专利权)人: | 武汉友芝友医疗科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京高文律师事务所 11359 | 代理人: | 程义贵 |
地址: | 430075 湖北省武汉市武汉东*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 人类 braf 基因 v600e 突变 检测 试剂盒 | ||
1.一种用于检测人类BRAF基因V600E突变的检测试剂盒,该试剂盒包括第一试剂包和第二试剂包,所述第一试剂包和第二试剂包各自包含PCR缓冲液,dNTP,MgCl2,特异性探针,锁核酸引物,内标系统,HotStartTaq酶、UNG酶,其中第一试剂包包含引物对SEQIDNO:1和SEQIDNO:2,探针SEQIDNO:3,第二试剂包包含引物对SEQIDNO:1和SEQIDNO:4,探针SEQIDNO:5,其中SEQIDNO:4为锁核酸引物。
2.如权利要求1所述的人类BRAF基因V600E突变的检测试剂盒,其特征在于,探针SEQIDNO:3、SEQIDNO:5的5’端连接有荧光基团,3’端连接有淬灭基团,所述荧光基团可以为FAM、VIC或HEX。
3.如权利要求1所述的人类BRAF基因V600E突变的检测试剂盒,其特征在于,所述内标系统包含内标引物和内标探针,所述内标引物序列为SEQIDNO:6和SEQIDNO:7,所述内标探针序列为SEQIDNO:8。
4.如权利要求3所述的人类BRAF基因V600E突变的检测试剂盒,其特征在于,所述内标探针5’端修饰有VIC,3’端修饰有TAMRA。
5.如权利要求1所述的人类BRAF基因V600E突变的检测试剂盒,其特征在于,第一试剂包和第二试剂包中均含有ROX参比校正。
6.如权利要求1所述的人类BRAF基因V600E突变的检测试剂盒,其特征在于,所述检测试剂盒含有阳性对照液和空白对照液,所述阳性对照液含有V600E突变质粒DNA,所述空白对照为Tris-HCl缓冲液。
7.一种简单快速检测人类BRAF基因V600E突变的方法,该方法包括以下步骤:
(1)设计并筛选含有人类BRAF基因质控的引物、探针,含有BRAF基因V600E突变的检测探针,ARMS引物,通用引物;
(2)获得待测样品基因组DNA;
(3)取权利要求1-6中任一项所述的检测试剂盒,将所述基因组DNA先后取相同的量加入所述第一试剂和所述第二试剂中并同时进行PCR反应,根据两个PCR反应体系分别得到的Ct值的差值△Ct判断是否具有相应的基因突变。
8.一种检测人类BRAF基因V600E突变的方法,该方法利用权利要求1至6任一项所述的检测试剂盒进行,该方法包括以下步骤:
(1)获得待测样品基因组DNA;
(2)将上述获得的基因组DNA先后取同样量分别加入含有本发明的检测试剂盒中第一试剂包的PCR反应体系和含有本发明的检测试剂盒中第二试剂包的PCR反应体系中,并使该两个反应体系同时进行PCR反应,两个PCR反应彼此独立进行,根据两个PCR反应体系分别得到的Ct值的差值△Ct判断是否具有相应的基因突变。
9.如权利要求7或8所述的方法,其特征在于,根据以下条件进行所述判断:
△Ct<9则待测样品存在BRAF基因V600E突变;△Ct值≥9则待测样品无BRAF基因V600E突变或突变丰度低于本试剂盒突变检测下限。
10.如权利要求7或8所述的方法,其特征在于,还包括对上样量是否合适进行判断的步骤,判断依据如下:
Ct0≤32则上样量合适,检测结果有效;Ct0>32则上样量偏低,需增加上样量后重新检测,
其中,所述Ct0为所述第一试剂包对应的Ct值。
11.如权利要求8所述的方法,其特征在于,所述△Ct值≥9的情况包括所述第二试剂包进行PCR反应后无Ct值的情况。
12.如权利要求7-11中任一项所述的方法,其特征在于,所述步骤(3)中PCR反应条件为:
95℃5~10min;
95℃15~30s,60℃45~60s,40~45个循环。
13.如权利要求7-11中任一项所述的检测方法,其特征在于,所述步骤(3)中PCR反应条件优选为:
37℃10min;
95℃5min;
95℃15s,60℃60s,45个循环。
14.如权利要求8所述的方法,其特征在于,V600E检测体系还能够很好的对V600其他突变模板进行区分,包括V600K,V600D,V600R,V600M突变模板。
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