[发明专利]一种神经外科手术后颅内细菌性感染常见致病细菌MLPA检测探针及其应用有效
申请号: | 201510361873.X | 申请日: | 2015-06-26 |
公开(公告)号: | CN105018601B | 公开(公告)日: | 2018-07-20 |
发明(设计)人: | 王明席;李云振;王庆波;姜涛 | 申请(专利权)人: | 华侨大学;厦门柏嘉生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/14;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 厦门市首创君合专利事务所有限公司 35204 | 代理人: | 张松亭 |
地址: | 362000*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 神经 外科手术 后颅内 细菌性 感染 常见 致病 细菌 mlpa 检测 探针 及其 应用 | ||
1.一种神经外科手术后颅内细菌性感染常见致病细菌MLPA检测探针,其特征在于:包括第一组探针至第十七组探针,依序为检测脑膜炎奈瑟氏菌、绿脓假单胞菌、沙门氏菌属、嗜麦芽寡养单胞菌、金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、克雷伯氏肺炎菌、粘质沙雷氏菌、鲁氏不动杆菌、白喉杆菌、缓症链球菌、鲍氏不动杆菌、肺炎链球菌、痤疮丙酸杆菌、李斯特氏菌、阴沟肠杆菌和流感嗜血杆菌的探针,每组探针分别由左侧探针LPO和右侧探针RPO组成,所述左侧探针由杂交序列和连接在杂交序列5’端的如SEQ ID NO 37所示的上游通用引物序列组成,所述右侧探针由杂交序列、连接在杂交序列5’端的如SEQ ID NO 35所示的BsmI酶切位点序列、连接在杂交序列3’端的EcoR V酶切位点序列GATATC以及连接在EcoR V酶切位点序列3’端的SEQ ID NO 38的反向互补序列组成,其中,
第一组探针的左侧探针LPO的杂交序列如SEQ ID NO 1所示,右侧探针RPO的杂交序列如SEQ ID NO 2所示;
第二组探针的左侧探针LPO的杂交序列如SEQ ID NO 3所示,右侧探针RPO的杂交序列如SEQ ID NO 4所示;
第三组探针的左侧探针LPO的杂交序列如SEQ ID NO 5所示,右侧探针RPO的杂交序列如SEQ ID NO 6所示;
第四组探针的左侧探针LPO的杂交序列如SEQ ID NO 7所示,右侧探针RPO的杂交序列如SEQ ID NO 8所示;
第五组探针的左侧探针LPO的杂交序列如SEQ ID NO 9所示,右侧探针RPO的杂交序列如SEQ ID NO 10所示;
第六组探针的左侧探针LPO的杂交序列如SEQ ID NO 11所示,右侧探针RPO的杂交序列如SEQ ID NO 12所示;
第七组探针的左侧探针LPO的杂交序列如SEQ ID NO 13所示,右侧探针RPO的杂交序列如SEQ ID NO 14所示;
第八组探针的左侧探针LPO的杂交序列如SEQ ID NO 15所示,右侧探针RPO的杂交序列如SEQ ID NO 16所示;
第九组探针的左侧探针LPO的杂交序列如SEQ ID NO 17所示,右侧探针RPO的杂交序列如SEQ ID NO 18所示;
第十组探针的左侧探针LPO的杂交序列如SEQ ID NO 19所示,右侧探针RPO的杂交序列如SEQ ID NO 20所示;
第十一组探针的左侧探针LPO的杂交序列如SEQ ID NO 21所示,右侧探针RPO的杂交序列如SEQ ID NO 22所示;
第十二组探针的左侧探针LPO的杂交序列如SEQ ID NO 23所示,右侧探针RPO的杂交序列如SEQ ID NO 24所示;
第十三组探针的左侧探针LPO的杂交序列如SEQ ID NO 25所示,右侧探针RPO的杂交序列如SEQ ID NO 26所示;
第十四组探针的左侧探针LPO的杂交序列如SEQ ID NO 27所示,右侧探针RPO的杂交序列如SEQ ID NO 28所示;
第十五组探针的左侧探针LPO的杂交序列如SEQ ID NO 29所示,右侧探针RPO的杂交序列如SEQ ID NO 30所示;
第十六组探针的左侧探针LPO的杂交序列如SEQ ID NO 31所示,右侧探针RPO的杂交序列如SEQ ID NO 32所示;
第十七组探针的左侧探针LPO的杂交序列如SEQ ID NO 33所示,右侧探针RPO的杂交序列如SEQ ID NO 34所示。
2.一种神经外科手术后颅内细菌性感染常见致病细菌MLPA检测试剂盒,其特征在于:包括权利要求1所述的探针。
3.如权利要求2所述的检测试剂盒,其特征在于:还包括一对通用引物,所述通用引物的上游引物和下游引物分别如SEQ ID NO 37和SEQ ID NO 38所示。
4.如权利要求3所述的检测试剂盒,其特征在于:还包括Ligase-65、Ligase buffer、Probe Mix和PCR Primer Mix,其中,
Ligase-65的配方为:1U/μL,其储存液为pH 7.5的20mM Tris,50mM KCl,1mM DTT,0.1mM EDTA和50%(v/v)甘油;
Ligase buffer的配方为:10×Ligation Buffer:pH 7.8的400mM Tris,100mM MgCl2,100mM DTT,5mM ATP;
Probe Mix的配方为:每个探针的浓度为4fM,工作液为pH 8.0的10mM Tris-Cl,1mMEDTA;
PCR Primer Mix的配方为:含有所述通用引物的上游引物和下游引物,dNTPs 2.5mM;工作液为pH 8.0的10mM Tris-Cl,1mM EDTA;每个引物的浓度为10pM,上游引物为Cy 5.0标记。
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