[发明专利]微量起始DNA的高通量测序文库构建方法及其所构建的高通量测序文库有效
申请号: | 201510369505.X | 申请日: | 2015-06-29 |
公开(公告)号: | CN104894651B | 公开(公告)日: | 2017-04-12 |
发明(设计)人: | 胡政;刘运超;王大伟;朱海浩;李明洲 | 申请(专利权)人: | 天津诺禾医学检验所有限公司 |
主分类号: | C40B40/06 | 分类号: | C40B40/06;C40B50/06;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京康信知识产权代理有限责任公司11240 | 代理人: | 赵囡囡,吴贵明 |
地址: | 301700 天津市*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 微量 起始 dna 通量 序文 构建 方法 及其 | ||
1.一种微量起始DNA的高通量测序文库构建方法,其特征在于,所述构建方法包括:
步骤S1,对样本DNA进行物理打断,得到片段化DNA;
步骤S2,对所述片段化DNA进行末端修复及加A,得到修复DNA;
步骤S3,利用连接增强剂对所述修复DNA进行接头连接,得到带接头片段;以及
步骤S4,对所述带接头片段进行扩增,得到所述高通量测序文库;
其中,所述连接增强剂为DMSO、乙醇、乙二醇或甘油。
2.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,在所述步骤S2中,利用高通量测序文库构建试剂盒中的修复酶混合物进行修复,所述高通量测序文库构建试剂盒中的修复酶混合物包括dNTPs、T4DNA聚合酶、T4PNK以及Klenow酶或Taq酶,并在所述修复过程中向所述修复酶混合物中添加dATP。
3.根据权利要求2所述的构建方法,其特征在于,所述高通量测序文库构建试剂盒包括NEB公司的DNA文库构建试剂盒、Bioo公司的DNA文库构建试剂盒或诺唯赞公司的DNA文库构建试剂盒。
4.根据权利要求2所述的构建方法,其特征在于,在所述修复过程中向所述修复酶混合物中添加小于等于0.4μl 100mM的dATP。
5.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,在所述步骤S3之后以及所述步骤S4之前,所述构建方法还包括对所述带接头片段进行磁珠纯化的步骤。
6.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述步骤S4包括:对所述连接片段进行分步扩增,并在每次扩增之后增加磁珠纯化的步骤,得到所述高通量测序文库。
7.根据权利要求1至6中任一项所述的构建方法,其特征在于,所述步骤S4包括:
对所述带接头片段扩增4~7个循环,得到第一扩增片段;
对所述第一扩增片段进行0.95~1.20倍体积的磁珠纯化,得到第一扩增纯化片段;
对所述第一扩增纯化片段扩增6~9个循环,得到第二扩增片段;
对所述第二扩增片段进行0.95~1.20倍体积的磁珠纯化,得到第二扩增纯化片段;以及
利用0.7~0.85倍体积的磁珠对所述第二扩增纯化片段进行分选,得到所述高通量测序文库。
8.一种高通量测序文库,其特征在于,所述高通量测序文库采用权利要求1至7中任一项所述的构建方法构建而成。
9.根据权利要求8所述的高通量测序文库,其特征在于,所述高通量测序文库的库容为50~500ng。
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