[发明专利]一种原子力显微镜检测单分子水平分子间相互作用的方法有效
申请号: | 201510378549.9 | 申请日: | 2015-07-01 |
公开(公告)号: | CN104991090A | 公开(公告)日: | 2015-10-21 |
发明(设计)人: | 毕赛;王宗花;贾晓强;陈敏;孔冬青 | 申请(专利权)人: | 青岛大学 |
主分类号: | G01Q60/24 | 分类号: | G01Q60/24;G01Q60/38 |
代理公司: | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人: | 董洁 |
地址: | 266071 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 原子 显微镜 检测 分子 水平 相互作用 方法 | ||
1.一种原子力显微镜用于检测单分子水平分子间相互作用的方法,其特征是:在基底表面修饰DNA1和在AFM探针上修饰DNA2;当AFM探针与基底表面靠近时,通过DNA1与DNA2的互补杂交,形成DNA1/DNA2双链结构;采用切刻内切酶特异性识别双链DNA1/DNA2中的特定序列,并将单链DNA1切断;然后采用原子力显微镜检测DNA之间的作用力,从而检测出DNA双链在切刻内切酶剪切前后DNA之间相互作用力的变化。
2.如权利要求1所述的方法,其特征是,所述AFM探针修饰DNA2的具体方法是:将AFM探针进行羟基化修饰,得到羟基修饰的AFM探针,然后活化羟基修饰的AFM探针,将活化后的AFM探针与氨基修饰的DNA2进行固定反应,取出AFM探针,对AFM探针进行后处理。
3.如权利要求1所述的方法,其特征是,所述基底表面上修饰DNA1的具体方法是:基底采用金基底,首先预处理金基底,然后将处理好的金基底与巯基修饰的DNA1进行固定反应,37℃反应3小时以上。
4.如权利要求1所述的方法,其特征是,所述采用原子力显微镜检测DNA之间的作用力的具体方法是:将缓冲溶液3滴在修饰有DNA1的金基底上,将液滴固定在原子显微镜的扫描器上,测DNA之间的相互作用力F1;使用切刻内切酶时,将含有1×切刻内切酶缓冲液、切刻内切酶和所述缓冲溶液3的混合溶液,滴加到金基底上,将液滴固定在原子显微镜的扫描器上,测DNA之间的相互作用力F2;从而检测出DNA双链在切刻内切酶剪切前后DNA之间相互作用力的变化。
5.如权利要求2所述的方法,其特征是:所述羟基化修饰的过程为:将AFM探针浸泡在浓硫酸和双氧水的混合溶液中30分钟,去离子水洗净,得到羟基修饰AFM探针。
6.如权利要求2所述的方法,其特征是:所述活化过程为:将羟基修饰的AFM探针浸泡在200μl浓度为100mM N-羟基琥珀酰亚胺(NHS)溶液中,避光放置30分钟后,去离子水冲洗干净。
7.如权利要求2所述的方法,其特征是:后处理的过程为:先用缓冲溶液2冲洗三次,再用去离子水洗净,空气中干燥30分钟;所述缓冲液2的组成:300mM NaCl,20mM Na2HPO4,2mM乙二胺四乙酸,7mM十二烷基硫酸钠,pH=7.4;作用:用于清洗AFM探针。
8.如权利要求2所述的方法,其特征是:所述固定反应的过程为:将修饰有DNA2的AFM探针浸泡在200μl浓度为1μM的氨基修饰DNA2溶液中,25℃反应12小时以上。
9.如权利要求3所述的方法,其特征是:所述预处理金基底的过程为:将金基底清洗、干燥;进一步具体的过程为:用清洗液浸泡超声10分钟,去离子水冲洗干净,氮气吹干;所述清洗液为:氨水和双氧水的混合溶液,其中水:氨水:双氧水的体积比为5:1:1。
10.如权利要求3所述的方法,其特征是:所述固定反应过程为:将处理好的金基底浸泡在1ml浓度为1μM的巯基修饰DNA1中进行固定反应。
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