[发明专利]星斑川鲽微卫星分子标记位点及引物有效
申请号: | 201510380762.3 | 申请日: | 2015-07-01 |
公开(公告)号: | CN104975012B | 公开(公告)日: | 2019-03-08 |
发明(设计)人: | 王波;郑风荣;李青 | 申请(专利权)人: | 国家海洋局第一海洋研究所 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/6888 |
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地址: | 266061 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 星斑川鲽微 卫星 分子 标记 引物 | ||
1.星斑川鲽微卫星分子标记,其特征在于序列表SEQ.ID.No.1至SEQ.ID.No.11中任一的碱基序列,它们分别标记编号为PT1、PT2、PT3、PT4、PT5、PT6、PT7、PT8、PT9、PT10、PT11。
2.权利要求1所述星斑川鲽微卫星分子标记的组合,其特征在于选自星斑川鲽微卫星分子标记PT1、PT2、PT3、PT4、PT5、PT6、PT7、PT8、PT9、PT10、PT11的两种或多种。
3.在权利要求1所述的微卫星两端的侧翼序列上设计的星斑川鲽微卫星引物,其特征在于:所述的微卫星引物序列为SEQ ID NO:12-33,其中序列12和13用于扩增PT1序列,序列14和15用于扩增PT2序列,以此类推。
4.权利要求3所述星斑川鲽微卫星引物的组合,其特征在于选自扩增PT1到PT11引物对的一组或两组。
5.权利要求1或2所述的星斑川鲽微卫星分子标记或其组合在星斑川鲽的种群遗传多样性检测、个体鉴定或分子辅助育种方面的应用。
6.权利要求3或4所述星斑川鲽微卫星分子标记的引物或其组合在星斑川鲽的种群遗传多样性检测、个体鉴定或分子辅助育种方面的应用。
7.根据权利要求5或6所述的应用,其特征在于星斑川鲽的遗传多样性检测包括以下步骤:
1)基因组DNA的提取:采用天根海洋动物组织DNA提取试剂盒;
2)微卫星PCR扩增:采用FAM、HEM、TAMRA荧光标记的微卫星引物扩增星斑川鲽基因组DNA,获得其扩增产物;
3)扩增产物电泳:在毛细管电泳基因分析仪上电泳,用GS500LIZ作分子量内标,个体扩增产物用peak Scanner Software(v1.0)对毛细管电泳数据初步处理;
4)遗传多样性分析:根据每个个体微卫星扩增产物的分子量的大小取定基因型,利用PopGene 32计算遗传多样性参数。
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