[发明专利]星斑川鲽微卫星分子标记位点及引物

说明书

本发明提供了星斑川鲽11个微卫星分子标记位点以及其多态性引物，所获引物的扩增结果具有高度的多态性和稳定性，为星斑川鲽的遗传多样性以及种群间的亲缘关系的鉴定提供资料，弥补现有技术的不足。

技术领域

本发明属于分子生物学DNA分子标记技术领域，具体涉及星斑川鲽微卫星分子标记的开发。

背景技术

星斑川鲽(Platichthys stellatus)又称星突江鲽，隶属鲽形目鲽科川鲽属，为广盐、冷水性种类，分布在中国、朝鲜、韩国、日本、俄罗斯及美国太平洋沿岸海域，在我国吉林省的图们江也有分布。由于星斑川鲽营养价值高，口感独特，味道鲜美，所以市场价值高，在国内外市场深受欢迎。目前，国内外有关星斑川鲽的研究报道还比较少，主要集中在生物学地位、生态分布以及种群资源量。另外，日本和法国学者利用同工酶分析了野生群体星斑川鲽的种群遗传结构，还有一些学者对其生理、生化等方面进行了研究，但目前对于星斑川鲽微卫星方面的研究则不多，在NCBI上公布的星斑川鲽的SSR序列只有158条，这在一定程度上限制了星斑川鲽的遗传育种和品质改良。

微卫星标记(SSRs：simple sequence repeats)或短串联重复(Short tandemrepeats，STRS)，是一种广泛应用的遗传学领域的DNA分子标记。SSRs是广泛存在真核生物基因组中的简单重复DNA片段，一般每个重复单位仅1-6个碱基，重复数为10-20次，其中动物体中以双核苷酸(CA/GT)n最为常见。微卫星具有多态性高，提供的遗传信息多，PCR扩增效果重复性好，以及在基因组中分散分布等优点，常用于生物的遗传多样性分析，遗传图谱和杂交育种等。由于微卫星研究所用DNA的数量少，对样品要求低，因此，微卫星分析在遗传学领域具有广泛的应用性。

发明内容

本发明的目的是提供星斑川鲽11个微卫星分子标记位点以及其多态性引物，为星斑川鲽的遗传多样性以及种群间的亲缘关系的鉴定提供资料，弥补现有技术的不足。

本发明利用高通量测序技术从星斑川鲽DNA基因组中筛选出11个微卫星位点，其核苷酸序列分别是PTS：1-11，其序列为SEQ ID：1-11。

微卫星序列还包括在严格条件下与上述的核苷酸序列杂交的，包含相同微卫星重复的核苷酸序列分子。

本发明微卫星引物是从序列SEQ ID：1-11的微卫星两端的侧翼序列上设计的正向、反向引物。微卫星引物序列分别是SEQ ID：12-33

微卫星位点，位点序列和对应的引物信息如表1：

表1