[发明专利]一种RAPD标记竹节参及其近缘植物的品种鉴别的方法有效
申请号: | 201510397829.4 | 申请日: | 2015-07-08 |
公开(公告)号: | CN105002272B | 公开(公告)日: | 2018-07-31 |
发明(设计)人: | 袁丁;张长城;刘朝奇;王婷;周志勇;许成;李菁 | 申请(专利权)人: | 三峡大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895 |
代理公司: | 宜昌市三峡专利事务所 42103 | 代理人: | 蒋悦 |
地址: | 443002*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 rapd 标记 竹节参 及其 近缘 植物 品种 鉴别 方法 | ||
1.一种RAPD标记竹节参及其近缘植物的品种鉴别的方法,可同时鉴别人参,西洋参,三七,珠子参,羽叶三七,竹节参,狭叶竹节参,其特征在于,包括如下步骤:
DNA的提取 常规提取竹节参及其近缘植物的叶片DNA,鉴定浓度和纯度;
PCR反应体系 将上述得到的DNA在PCR反应液下进行扩增反应,其DNA的扩增程序为94℃预变性5min;94℃变性45s,36℃退火60s,72℃延伸90s,循环39次;72℃补充延伸7min,确定得到稳定的扩增产物,即为PCR反应产物,同时PCR扩增反应均设不含模板DNA的空白对照;
RAPD引物筛选 收集RAPD引物,应用软件比对后筛选随机引物,再将随机引物经过RAPD的PCR反应,进行电泳,凝胶分析系统检测照相,筛选的RAPD引物包括F02 5’→3’GAGGATCCCT、I13 5’→3’ CTCTCCGCCA、H03 5’→3’ AGACGTCCAC、F01 5’→3’ ACGGATCCTG;
RAPD-PCR检测竹节参及其近缘植物中DNA扩增产物 应用筛选到的引物,通过优化的PCR反应条件,检测竹节参及其近缘植物中DNA的RAPD-PCR产物,并进行带型分析;
数据分析 根据随机引物PCR扩增电泳图谱,将相同的分子量片段处产生特异性条带的有无进行统计分析,利用特异性条带的有无可将竹节参及其近缘植物分组,使用多个随机引物的分组结果的组合,可以将竹节参及其近缘植物一一区分开来;鉴别人参的带型为F02引物扩增的1100bp(+)700bp(-)和I13引物扩增的800bp(+);
鉴别西洋参的带型为F02引物扩增的1100bp(+)700bp(-)和I13引物扩增的800bp(-);
鉴别竹节参的带型为F02引物扩增的1100bp(-)700bp(+),H03引物扩增的300bp(+)以及I13引物扩增的450bp(+);
鉴别狭叶竹节参的带型为F02引物扩增的1100bp(-)700bp(+),H03引物扩增的300bp(-)以及F01引物扩增的500bp(+);
鉴别羽叶三七的带型为F02引物扩增的1100bp(-)700bp(+),H03引物扩增的300bp(-)以及F01引物扩增的500bp(-);
鉴别珠子参的带型为F02引物扩增的1100bp(-)700bp(+),H03引物扩增的300bp(+)以及I13引物扩增的450bp(-);
鉴别三七的带型为F02引物扩增的1100bp(-)700bp(-)。
2.根据权利要求1所述的RAPD标记竹节参及其近缘植物的品种鉴别的方法,其特征在于,PCR反应液包括25mM的MgCl2、10× Taq buffer with KCl、1U/μL的Taq酶、10mM的dNTPMixture、10mM引物,按体积比为6:5:3:1:4的混合原料,其他为灭菌双蒸水,所述的引物为10个碱基的RAPD随机引物。
3.根据权利要求1所述的RAPD标记竹节参及其近缘植物的品种鉴别的方法,其特征在于,所述的10× Taq buffer with KCl为pH8.8的100mM Tris-HCl,500mM KCl,0.8%(v/v)Nonidet P40的混合物。
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