[发明专利]一种与鸡优良屠宰性状相关的鸡FABP4基因分子遗传标记及其应用在审
申请号: | 201510401900.1 | 申请日: | 2015-07-09 |
公开(公告)号: | CN104946776A | 公开(公告)日: | 2015-09-30 |
发明(设计)人: | 马韫韬 | 申请(专利权)人: | 马韫韬 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人: | 李健康 |
地址: | 250000 山东省济南市*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 优良 屠宰 性状 相关 fabp4 基因 分子 遗传 标记 及其 应用 | ||
技术领域
本发明属于分子生物技术领域,尤其涉及一种与肉食鸡优良屠宰性状相关的鸡FABP4基因分子遗传标记及其在辅助筛选或预测具备优良屠宰性状的肉食鸡品种中的应用。
背景技术
分子遗传标记是以物种突变造成DNA片段长度多态性为基础的,具有许多优点;(1)直接探测DNA水平的差异,不受时间空间的限制;(2)标记数量丰富、多态性高;(3)共显性标识,可以区分纯合子与杂合子;(4)可以解释家系内某些个体的遗传变异;(5)可以鉴定不同性别、不同年龄的个体。单核苷酸多态性标记(single nucleotide polymorphism,SNP)是DNA遗传标记中的一种类型,是同一物种不同个体基因组DNA等位序列上单个核苷酸存在差别的现象,其比较的是同序列长度里单个碱基的差别。在基因组中,SNPs既可存在于基因序列中,也可存在于基因以外的非编码序列中。存在于编码序列中的SNPs虽然较少,但是在遗传学研究中却具有重要意义。
SNPs自身的特性决定了它在生物学诸多领域的研究中具有特殊的应用价值,主要在于:(1)SNPs数量多,分布广泛,几乎遍布于整个群体基因组中;(2)SNPs适于快速、规模化筛查;(3)SNPs等位基因的频率容易估计,同时也易于基因分型。目前SNPs的检测和筛选方法大致可以分为两类:一类是直接查找法,即运用现代生物信息学手段,从已有的核苷酸数据库中寻找SNPs;另一种是实验法,又可分为四种类型,即直接测序法、DNA分子构象法、基因芯片技术以及限制性酶切法。其中使用限制性酶切检测SNPs具备了简便、快速、灵敏和经济的特点,非常适用于大批量样品的分析。该方法的核心在于选择合适的内切酶,使得基因中的单碱基改变通过琼脂糖凝胶电泳中的片段差异体现出来,就可以初步获悉基因的单核苷酸多态性特征。
脂肪酸结合蛋白(Fatty acid binding protein,FABP)广泛存在于脊椎动物和费脊椎动物的细胞质中,属于脂质结合蛋白超家族成员,迄今为止已经发现了9种类型的FABP。各种不同类型的脂肪酸结合蛋白分布具有组织特异性,但都是对脂肪酸具有高亲和力的可溶性蛋白质。FABP的基本功能是在细胞内进行脂肪酸短暂的贮存与运输,并广泛参与脂肪酸的转运代谢,可将脂肪酸从细胞膜运送到脂肪酸氧化、甘油三酯和磷脂合成的位置,并在细胞内与脂肪酸结合,造成细胞内外脂肪酸浓度差,从而促进细胞摄取脂肪酸。FABP4指的是脂肪细胞型脂肪酸结合蛋白,是哺乳动物甘油三酯的贮存库,在脂肪细胞分化过程中FABP4表达与活性显著增强,在甘油三酯形成及脂解过程中,FABP4除存货释放大量脂肪酸,参与调控甘油三酯生成及溶解的生化循环。作为分子标记,FABP4表现出高遗传的多态性。
脂肪性状是评价鸡肉品质的重要指标,特别是肌内脂肪含量,此类性状的发育会直接影响其商品性能。因此,对于调控脂肪性状发育基因的SNPs的表征对于通过肉鸡的分子育种和辅助选择提高其生产性能具有十分重要的作用。在申请人相关实验所涉及鸡的群体中,FABP4单核苷酸未突变的个体其产肉率以及肉质均优于纯合突变个体以及杂合突变个体,从数据上直观地体现了FABP4基因SNPs对鸡生产性状的影响。这一发现若应用到优质家禽的育种等研究工作中,有望为培育出高产优质肉性状的优良品种提供帮助。经检索,目前FABP4基因SNPs作为遗传标记,特别是作为肉食鸡的优良屠宰性状分子遗传标记应用于筛选或预测具备优良屠宰性状的肉食鸡品种还未见报道。
发明内容
针对现有技术的不足,本发明要解决的问题是提供一种与肉食鸡优良屠宰性状相关的鸡FABP4基因分子遗传标记及其在辅助筛选或预测具备优良屠宰性状的肉食鸡品种中的应用。
本发明所述的与肉食鸡优良屠宰性状相关的鸡FABP4基因分子遗传标记是鸡FABP4基因单核苷酸多态性序列上的多态性位点,其特征在于:所述鸡FABP4基因单核苷酸多态性序列的多态性位点是在FABP4基因序列第一外显子的第51位为C或T的碱基多态性位点,表现为CC、CT或TT三种基因型,其中CC型为肉食鸡的优良屠宰性状分子遗传标记。
本发明所述与肉食鸡优良屠宰性状相关的鸡FABP4基因分子遗传标记在辅助筛选或预测具备优良屠宰性状的肉食鸡品种中的应用。
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