[发明专利]一种一次制备多个DNA大片段插入双末端测序文库的方法有效

专利信息
申请号: 201510430638.3 申请日: 2015-07-21
公开(公告)号: CN105002570B 公开(公告)日: 2017-09-05
发明(设计)人: 常玉晓;赵胜;刘可 申请(专利权)人: 中国农业科学院深圳农业基因组研究所
主分类号: C40B50/06 分类号: C40B50/06;C12Q1/68
代理公司: 深圳中一专利商标事务所44237 代理人: 张全文
地址: 518120 广*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 一次 制备 dna 片段 插入 末端 序文 方法
【权利要求书】:

1.一种一次制备多个DNA大片段插入双末端测序文库的方法,包括以下步骤:

将待测DNA打断后连接上带有生物素的DNA接头,得到生物素标记的DNA片段;

将所述生物素标记的DNA片段分选成N个不同大小的DNA片段,其中,10≤N≤12,所述将待测DNA打断的步骤中,采用Tn5转座酶复合体将待测DNA打断并加上带有生物素修饰的DNA接头,且所述Tn5转座酶复合体和所述待测DNA的比例为3-5.5μL Tn5转座酶复合体:1μg待测基因组DNA;

将所述N个不同大小的DNA片段分别进行环化处理得到环状DNA;

然后清除未环化的线性DNA片段;

将所述环状DNA打断后连接上带有不同barcode的Truseq接头,得到含有不同Truseq barcode接头的DNA片段;

将所述带有Truseq barcode接头的DNA片段混合,并与链霉亲和素磁珠反应,富集带有生物素标记的DNA片段;

PCR扩增所述带有生物素标记的DNA片段并测序。

2.如权利要求1所述的一次制备多个DNA大片段插入双末端测序文库的方法,其特征在于,对所述生物素标记的DNA片段进行片段分选采用SAGE Science公司的SAGE ELF实现,具体方法为:

将生物素标记的DNA片段和加样缓冲液进行混合处理,将得到的混合样品加入到SageELF 0.75%琼脂糖凝胶DNA回收胶盒中,使用“时间”模式电泳200-260min,回收不同长度的DNA片段。

3.如权利要求1所述的一次制备多个DNA大片段插入双末端测序文库的方法,其特征在于,所述环化处理的方法为:

将所述N个不同大小的DNA片段、T4 DNA连接酶、T4 DNA连接酶缓冲液混合得到混合液,并使得所述混合液中所述T4 DNA连接酶的终浓度为0.10-0.30U/μL,所述DNA片段的终浓度为1.0-3.0ng/μL;

将所述混合液在16℃条件下反应1-17小时。

4.如权利要求1-3任一所述的一次制备多个DNA大片段插入双末端测序文库的方法,其特征在于,所述清除未环化的线性片段的方法为:

按下述比例配置得到反应体系:

将所述反应体系在37℃条件下反应30-90min后,70℃灭活酶蛋白30min。

5.如权利要求1所述的一次制备多个DNA大片段插入双末端测序文库的方法,其特征在于,将所述环状DNA打断为300-800bp大小的DNA片段。

6.如权利要求1-3任一所述的一次制备多个DNA大片段插入双末端测序文库的方法,其特征在于,在打断的DNA片段上连接具有不同序列的Truseq接头。

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