[发明专利]一种一次制备多个DNA大片段插入双末端测序文库的方法有效
申请号: | 201510430638.3 | 申请日: | 2015-07-21 |
公开(公告)号: | CN105002570B | 公开(公告)日: | 2017-09-05 |
发明(设计)人: | 常玉晓;赵胜;刘可 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院深圳农业基因组研究所 |
主分类号: | C40B50/06 | 分类号: | C40B50/06;C12Q1/68 |
代理公司: | 深圳中一专利商标事务所44237 | 代理人: | 张全文 |
地址: | 518120 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 一次 制备 dna 片段 插入 末端 序文 方法 | ||
1.一种一次制备多个DNA大片段插入双末端测序文库的方法,包括以下步骤:
将待测DNA打断后连接上带有生物素的DNA接头,得到生物素标记的DNA片段;
将所述生物素标记的DNA片段分选成N个不同大小的DNA片段,其中,10≤N≤12,所述将待测DNA打断的步骤中,采用Tn5转座酶复合体将待测DNA打断并加上带有生物素修饰的DNA接头,且所述Tn5转座酶复合体和所述待测DNA的比例为3-5.5μL Tn5转座酶复合体:1μg待测基因组DNA;
将所述N个不同大小的DNA片段分别进行环化处理得到环状DNA;
然后清除未环化的线性DNA片段;
将所述环状DNA打断后连接上带有不同barcode的Truseq接头,得到含有不同Truseq barcode接头的DNA片段;
将所述带有Truseq barcode接头的DNA片段混合,并与链霉亲和素磁珠反应,富集带有生物素标记的DNA片段;
PCR扩增所述带有生物素标记的DNA片段并测序。
2.如权利要求1所述的一次制备多个DNA大片段插入双末端测序文库的方法,其特征在于,对所述生物素标记的DNA片段进行片段分选采用SAGE Science公司的SAGE ELF实现,具体方法为:
将生物素标记的DNA片段和加样缓冲液进行混合处理,将得到的混合样品加入到SageELF 0.75%琼脂糖凝胶DNA回收胶盒中,使用“时间”模式电泳200-260min,回收不同长度的DNA片段。
3.如权利要求1所述的一次制备多个DNA大片段插入双末端测序文库的方法,其特征在于,所述环化处理的方法为:
将所述N个不同大小的DNA片段、T4 DNA连接酶、T4 DNA连接酶缓冲液混合得到混合液,并使得所述混合液中所述T4 DNA连接酶的终浓度为0.10-0.30U/μL,所述DNA片段的终浓度为1.0-3.0ng/μL;
将所述混合液在16℃条件下反应1-17小时。
4.如权利要求1-3任一所述的一次制备多个DNA大片段插入双末端测序文库的方法,其特征在于,所述清除未环化的线性片段的方法为:
按下述比例配置得到反应体系:
将所述反应体系在37℃条件下反应30-90min后,70℃灭活酶蛋白30min。
5.如权利要求1所述的一次制备多个DNA大片段插入双末端测序文库的方法,其特征在于,将所述环状DNA打断为300-800bp大小的DNA片段。
6.如权利要求1-3任一所述的一次制备多个DNA大片段插入双末端测序文库的方法,其特征在于,在打断的DNA片段上连接具有不同序列的Truseq接头。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于中国农业科学院深圳农业基因组研究所,未经中国农业科学院深圳农业基因组研究所许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201510430638.3/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。
- 上一篇:一种用于紧固件拉伸试验的多工位集成夹具
- 下一篇:一种简便的弯曲试验机夹具