[发明专利]一种鉴定或辅助鉴定大豆籽粒棕榈酸含量的方法及其应用有效
申请号: | 201510437818.4 | 申请日: | 2015-07-23 |
公开(公告)号: | CN105132531B | 公开(公告)日: | 2017-11-28 |
发明(设计)人: | 邱丽娟;李英慧 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院作物科学研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司11245 | 代理人: | 关畅,何叶喧 |
地址: | 100081 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴定 辅助 大豆 籽粒 棕榈 含量 方法 及其 应用 | ||
1.一种鉴定或辅助鉴定大豆籽粒棕榈酸含量性状的方法,包括如下步骤:检测待测大豆基因组中基于Map-6064SNP位点的基因型,如果为TT纯合型、待测大豆籽粒为候选的具有低棕榈酸含量性状的大豆籽粒,如果为CC纯合型、待测大豆籽粒为候选的具有高棕榈酸含量性状的大豆籽粒;所述Map-6064SNP位点的所在基因为大豆基因组第5条染色体的Glyma.05G015400基因;所述Glyma.05G015400基因的核苷酸序列为序列表的序列1;所述Map-6064SNP位点为序列表中序列1的第891位;所述低棕榈酸含量指的是棕榈酸含量小于12.3%;所述高棕榈酸含量指的是棕榈酸含量可为12.3%以上。
2.一种筛选或辅助筛选具有不同棕榈酸含量的大豆籽粒的方法,包括如下步骤:检测待测大豆基因组中基于Map-6064SNP位点的基因型,如果为TT纯合型、待测大豆籽粒为候选的具有低棕榈酸含量性状的大豆籽粒,如果为CC纯合型、待测大豆籽粒为候选的具有高棕榈酸含量性状的大豆籽粒;所述Map-6064SNP位点的所在基因为大豆基因组第5条染色体的Glyma.05G015400基因;所述Glyma.05G015400基因的核苷酸序列为序列表的序列1;所述Map-6064SNP位点为序列表中序列1的第891位;所述低棕榈酸含量指的是棕榈酸含量小于12.3%;所述高棕榈酸含量指的是棕榈酸含量可为12.3%以上。
3.一种产品,为检测大豆基因组中基于Map-6064SNP位点的多态性或基因型的物质;所述产品的功能为如下(a)、(b)或(c):
(a)鉴定或辅助鉴定大豆籽粒的棕榈酸含量性状;
(b)鉴定或辅助鉴定大豆籽粒棕榈酸含量性状相关的单核苷酸多态性;
(c)筛选或辅助筛选具有不同棕榈酸含量的大豆籽粒;
所述Map-6064SNP位点的所在基因为大豆基因组第5条染色体的Glyma.05G015400基因;所述Glyma.05G015400基因的核苷酸序列为序列表的序列1;所述Map-6064SNP位点为序列表中序列1的第891位。
4.检测大豆基因组中基于Map-6064SNP位点的多态性或基因型的物质的应用,为如下(1)、(2)、(3)、(4)、(5)或(6):
(1)鉴定或辅助鉴定大豆籽粒的棕榈酸含量性状;
(2)制备鉴定或辅助鉴定大豆籽粒的棕榈酸含量性状的产品;
(3)鉴定或辅助鉴定大豆籽粒棕榈酸含量性状相关的单核苷酸多态性;
(4)制备鉴定或辅助鉴定大豆籽粒棕榈酸含量性状相关的单核苷酸多态性的产品;
(5)筛选或辅助筛选具有不同棕榈酸含量的大豆籽粒;
(6)制备筛选或辅助筛选具有不同棕榈酸含量的大豆籽粒的产品;
所述Map-6064SNP位点的所在基因为大豆基因组第5条染色体的Glyma.05G015400基因;所述Glyma.05G015400基因的核苷酸序列为序列表的序列1;所述Map-6064SNP位点为序列表中序列1的第891位。
5.如权利要求3所述的产品或权利要求4所述的应用,其特征在于:所述大豆基因组中基于Map-6064SNP位点的基因型为TT纯合型或CC纯合型。
6.如权利要求3所述的产品或权利要求4所述的应用,其特征在于:所述棕榈酸含量为高棕榈酸含量或低棕榈酸含量;所述高棕榈酸含量指的是棕榈酸含量为12.3%以上;所述低棕榈酸含量指的是棕榈酸含量小于12.3%。
7.如权利要求3所述的产品或权利要求4所述的应用,其特征在于:所述用于检测大豆基因组中基于Map-6064 SNP位点的多态性或基因型的物质包括Map-6064SNP探针组;
所述Map-6064SNP探针组由探针1、探针2和探针3组成;
所述探针1为序列表中序列2所示的单链DNA分子;
所述探针2为序列表中序列3所示的单链DNA分子;
所述探针3为序列表中序列4所示的单链DNA分子。
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