[发明专利]针对wbgZ基因鉴定宋内氏志贺氏菌的实时荧光PCR方法和试剂盒在审
申请号: | 201510444097.X | 申请日: | 2015-07-27 |
公开(公告)号: | CN104962652A | 公开(公告)日: | 2015-10-07 |
发明(设计)人: | 王海艳;敖威华;赵治国;张捷;催强;赵林立;李刚;潘国卿;韩祎陟 | 申请(专利权)人: | 内蒙古出入境检验检疫局检验检疫技术中心 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 北京康思博达知识产权代理事务所(普通合伙) 11426 | 代理人: | 余光军 |
地址: | 010020 内蒙古*** | 国省代码: | 内蒙古;15 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 针对 wbgz 基因 鉴定 宋内氏志贺氏菌 实时 荧光 pcr 方法 试剂盒 | ||
1.针对wbgZ基因鉴定宋内氏志贺氏菌的实时荧光PCR的引物对及探针,其特征在于:所述引物对由核苷酸序列为SEQ ID No.1所示的上游引物和核苷酸序列为SEQ ID No.2所示的下游引物组成;所述探针的核苷酸序列为SEQ ID No.3所示;或者,
所述引物对由核苷酸序列为SEQ ID No.4所示的上游引物和核苷酸序列为SEQ ID No.5所示的下游引物组成;所述探针的核苷酸序列为SEQ ID No.6所示;或者,
所述引物对由核苷酸序列为SEQ ID No.7所示的上游引物和核苷酸序列为SEQ ID No.8所示的下游引物组成;所述探针的核苷酸序列为SEQ ID No.9所示。
2.权利要求1所述引物对及探针在鉴定宋内氏志贺氏菌中的应用。
3.一种针对wbgZ基因鉴定宋内氏志贺氏菌的实时荧光PCR方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)提取待检测样品的DNA;(2)以提取的DNA为模板,以权利要求1所述引物对和探针建立PCR反应体系,进行实时荧光PCR扩增;(3)如果实时荧光PCR扩增结果中出现S型扩增曲线,则判定待检测样品中含有宋内氏志贺氏菌;如果实时荧光PCR扩增结果中没有出现S型扩增曲线,则判定待检测样品中不含宋内氏志贺氏菌。
4.按照权利要求3所述的实时荧光PCR方法,其特征在于:所述PCR反应体系的总体积为25μL;其中,FastStart Universal Probe Master 12.5μL,10pmol/μL上游引物1.0μL,10pmol/μL下游引物1.0μL,10pmol/μL探针1.0μL,20μg/mL的模板DNA 2.0μL,余量为灭菌蒸馏水。
5.按照权利要求4所述的实时荧光PCR方法,其特征在于:所述上游引物的核苷酸序列为SEQ ID No.1所示,所述下游引物的核苷酸序列为SEQ ID No.2所示,所述探针的核苷酸序列SEQ ID No.3所示。
6.按照权利要求3、4或5所述的实时荧光PCR方法,其特征在于:所述探针的5’端标记有荧光报告基团,3’端标记有荧光淬灭基团;
优选的,所述荧光报告基团为FAM荧光报告基团,所述荧光淬灭基团为TAMRA荧光淬灭基团。
7.按照权利要求3所述的实时荧光PCR方法,其特征在于:所述实时荧光PCR扩增的条件为:95℃3min;95℃变性30s,59℃退火30s,40个循环。
8.一种宋内氏志贺氏菌的实时荧光PCR检测试剂盒,包括:FastStart Universal Probe Master,扩增引物对、探针和灭菌蒸馏水;其特征在于:所述扩增引物对由核苷酸序列为SEQ ID No.1所示的上游引物和核苷酸序列为SEQ ID No.2所示的下游引物组成;所述探针的核苷酸序列为SEQ ID No.3所示。
9.按照权利要求8所述的实时荧光PCR检测试剂盒,其特征在于,还包括:内参照引物对和探针;
优选的,所述内参照引物对由核苷酸序列为SEQ ID No.10所示的上游引物和核苷酸序列为SEQ ID No.11所示的下游引物组成,所述探针的核苷酸序列为SEQ ID No.12所示;或者,
所述内参照引物对由核苷酸序列为SEQ ID No.13所示的上游引物和核苷酸序列为SEQ ID No.14所示的下游引物组成,所述探针的核苷酸序列为SEQ ID No.15所示;或者,
所述内参照引物对由核苷酸序列为SEQ ID No.16所示的上游引物和核苷酸序列为SEQ ID No.17所示的下游引物组成,所述探针的核苷酸序列为SEQ ID No.18所示;
更优选的,所述内参照引物对的退火温度为57℃。
10.按照权利要求8或9所述的实时荧光PCR检测试剂盒,其特征在于:所述探针的5’端标记有荧光报告基团,3’端标记有荧光淬灭基团;
优选的,所述荧光报告基团为FAM荧光报告基团,所述荧光淬灭基团为TAMRA荧光淬灭基团。
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