[发明专利]基于CTAB法快速提取动物粪便基因组的试剂盒在审
申请号: | 201510449346.4 | 申请日: | 2015-07-28 |
公开(公告)号: | CN104975004A | 公开(公告)日: | 2015-10-14 |
发明(设计)人: | 王清水;余彦 | 申请(专利权)人: | 福建师范大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 福州君诚知识产权代理有限公司 35211 | 代理人: | 戴雨君 |
地址: | 350007 福建省福*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 ctab 快速 提取 动物 粪便 基因组 试剂盒 | ||
1.一种基于CTAB法快速提取动物粪便基因组的试剂盒 ,包括粪便的前处理、粪便中微生物细胞的裂解、DNA的游离与杂蛋白的抽除,DNA吸附柱吸附DNA以及杂质的去除,DNA洗脱,其特征是:
粪便的前处理:称取0.3-0.5g新鲜粪便于2ml离心管中,加入1-2ml Buffer A振荡1-2min, 3000-5000rpm/min离心10-20min,转移上清至新的离心管中,10000-12000rpm/min离心10-20min,弃上清,保留沉淀;
粪便中微生物细胞的裂解:往沉淀中加入450-600μl Buffer B和50-60μl Buffer C,混匀后37-40℃水浴1-2h,加入65-70μl Buffer D和65-70μl Buffer E,混匀后37-60℃水浴1-2h,加入100-200μl Buffer F和50-100μl Buffer G溶液,65-80℃水浴10-20min;
DNA的游离与杂蛋白的抽除:往溶液中加入600-800μl Buffer H,振荡器震荡30-60s后,12000-13000rpm/min 离心10-20min,将上清移至新的离心管中,加入等体积的Buffer I,12000-13000rpm/min 离心10-20min,将上清移至新的离心管中;
DNA吸附柱吸附DNA以及杂质的去除:往离心管中加入两倍体积的沉淀剂,混匀后加入DNA吸附柱,10000-13000rpm/min 离心1-2min,弃废液,加入500-600μl去蛋白液, 10000-13000rpm/min 离心1-2min,弃废液,加入300-500μl漂洗液,12000-13000rpm/min 离心1-2min,弃废液,加入500-600μl漂洗液, 12000-13000rpm/min 离心1-2min,弃废液, 12000-13000rpm/min 离心1-2min,静置吹干;
DNA洗脱:往吸附柱中加入30-60μl洗脱液,12000-13000rpm/min 离心1-2min,所得液体为粪便微生物基因组,取3-6μl DNA水溶液,于1-2%琼脂糖凝胶中电泳检测。
2.根据权利要求1所述的一种基于CTAB法快速提取动物粪便基因组的试剂盒,其特征是所述的DNA吸附柱为硅胶模吸附柱。
3.根据权利要求1所述的一种基于CTAB法快速提取动物粪便基因组的试剂盒,其特征是所述的Buffer A:0.25-0.37 mol/L磷酸二氢钾,0.175-0.2 mol/L氢氧化钠,PH=7-8;所述的Buffer B:10-20mM三羟甲基氨基甲烷,1-10mM乙二胺四乙酸,PH=5.0-8.0;所述的Buffer C为10-50mg/ml的溶菌酶;所述的Buffer D为20-50mg/ml的蛋白酶K;所述的Buffer E: 10-20%的十二烷基硫酸钠;所述的Buffer F: 3-8mol/L的氯化钠;所述的Buffer G: 0.14-0.28mol/L十六烷基三甲基溴化铵,0.5-1mol/ L氯化钠;所述的Buffer H: 酚:氯仿:异戊醇的体积比为25:24:1;所述的Buffer I: 氯仿:异戊醇的体积比为24:1。
4.根据权利要求1所述的一种基于CTAB法快速提取动物粪便基因组的试剂盒,其特征是所述的沉淀剂为70-80%的无水乙醇。
5.根据权利要求1所述的一种基于CTAB法快速提取动物粪便基因组的试剂盒,其特征是所述的去蛋白液:3-6M盐酸胍,10-30 mM三羟甲基氨基甲烷,pH=6.0-7.0,用前加乙醇,使得乙醇在去蛋白液中的终浓度为30-40%。
6.根据权利要求1所述的一种基于CTAB法快速提取动物粪便基因组的试剂盒,其特征是所述的漂洗液:20-50mM氯化钠,2-5mM三羟甲基氨基甲烷,pH=7.0-8.0,80-90%比重无水乙醇。
7.根据权利要求1所述的一种基于CTAB法快速提取动物粪便基因组的试剂盒,其特征是所述的洗脱液:10-20mM三羟甲基氨基甲烷,pH=8.0-9.0 。
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