[发明专利]富集短链核酸的方法在审

专利信息
申请号: 201510474196.2 申请日: 2006-12-08
公开(公告)号: CN105018470A 公开(公告)日: 2015-11-04
发明(设计)人: C·瑞特;R·西麦尔里奇;M·韦伯 申请(专利权)人: 恰根有限公司
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10
代理公司: 上海专利商标事务所有限公司 31100 代理人: 陶启长
地址: 德国*** 国省代码: 德国;DE
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摘要:
搜索关键词: 富集 核酸 方法
【权利要求书】:

1.一种富集长度小于300个核苷酸的核酸的方法,所述方法包括以下步骤:

i)提供流体相,优选水相,P1,其中含有

(α1)至少一种长度小于300个核苷酸的核酸,和

(α2)至少一种不同于所述核酸(α1)的组分,

ii)使所述相P1接触阴离子交换基质以使所述核酸(α1)结合于阴离子交换基质上,

iii)任选地用洗涤缓冲液洗涤所述阴离子交换基质,其中所述核酸(α1)仍旧结合于阴离子交换基质,和

iv)从所述阴离子交换基质上除去,优选洗脱,结合于阴离子交换基质的核酸(α1)以获得含有核酸(α1)的流体相,优选水相,P2

2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述核酸(α1)是RNA。

3.如权利要求2所述的方法,其特征在于,所述RNA选自下组:miRNA,前miRNA,siRNA,snRNA,snoRNA,tRNA,5S-rRNA,5.8S-rRNA,或其中至少两种的混合物。

4.如权利要求3所述的方法,其特征在于,所述RNA是miRNA、前miRNA、tRNA或者miRNA和tRNA的混合物。

5.如上述权利要求中任一项所述的方法,其特征在于,所述阴离子交换基质具有选自下组的官能团:氨基、膦基,肼基和亚胺基。

6.如上述权利要求中任一项所述的方法,其特征在于,所述阴离子交换基质以颗粒、过滤器、膜、整料、微滴定板或其它反应容器上涂层的形式存在。

7.如权利要求6所述的方法,其特征在于,所述颗粒是磁性颗粒,优选超顺磁性、亚铁磁性或铁磁性颗粒。

8.如上述权利要求中任一项所述的方法,其特征在于,所述核酸(α1)在存在0.01-10mol/l NaCl时在方法步骤ii)中结合于所述阴离子交换基质。

9.如上述权利要求中任一项所述的方法,其特征在于,所述洗涤缓冲液是不含RNA酶的水。

10.如上述权利要求中任一项所述的方法,其特征在于,方法步骤iv)中的分离通过洗脱缓冲液进行。

11.如权利要求10所述的方法,其特征在于,所述洗脱缓冲液含有水溶性钙盐、水溶性镁盐、水溶性铵盐或其混合物。

12.如权利要求10或11所述的方法,其特征在于,所述洗脱缓冲液含有浓度为1-1000mmol/l的氯化钙。

13.如权利要求10-12中任一项所述的方法,其特征在于,所述洗脱缓冲液含有浓度为1-1000mmol/l的氯化镁。

14.如权利要求10-13中任一项所述的方法,其特征在于,所述洗脱缓冲液含有浓度为1-1000mmol/l的硫酸铵或氯化铵。

15.如上述权利要求中任一项所述的方法,其特征在于,方法步骤i)中提供的水相P1是细胞裂解物。

16.如权利要求15所述的方法,其特征在于,所述细胞裂解物可通过包括以下步骤的方法获得:

I)提供细胞,

II)裂解细胞以获得细胞裂解物,和

III)任选地从所述细胞裂解物中至少部分地分离至少一种不同于核酸(α1)的组分(α2)。

17.如权利要求2-16中任一项所述的方法,其特征在于,基于所述相P2中RNA总量的所述相P2中长度小于300个核苷酸的RNA的相对量比基于所述相P1中RNA总量的所述相P1中长度小于300个核苷酸的RNA的相对量大至少2倍。

18.如权利要求4-17中任一项所述的方法,其特征在于,基于水相P2中miRNA和tRNA总量的水相P2中miRNA的相对量比基于水相P1中miRNA和tRNA总量的水相P1中miRNA的相对量大至少2倍。

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