[发明专利]植物多基因敲除载体的构建及应用有效

专利信息
申请号: 201510485573.2 申请日: 2015-08-09
公开(公告)号: CN105112435B 公开(公告)日: 2018-11-27
发明(设计)人: 王克剑;王春;沈兰;付亚萍;严长杰 申请(专利权)人: 中国水稻研究所
主分类号: C12N15/66 分类号: C12N15/66;C12N15/82
代理公司: 杭州中成专利事务所有限公司 33212 代理人: 金祺
地址: 310006 浙江*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 植物 多基因 载体 构建 应用
【权利要求书】:

1.植物多基因敲除载体的构建方法,其特征是包括如下步骤:

1)、双元表达载体pC1300-Cas9的构建:

以双元载体pCAMBIA1300为骨架载体,融合了2×CaMV 35S启动子,经密码子优化的Cas9核酸序列,及CaMV终止子;在2×CaMV 35S启动子前,设计了KpnI和BamHI这两个单酶切位点,用于连接单个或多个gRNA;

2)、中间载体SK-gRNA的构建:

以pBlueScript SK(+)为骨架载体,融合了水稻的U3启动子/拟南芥的U6启动子,gRNA骨架序列及poly-T尾巴,用于敲除单子叶植物基因/敲除双子叶植物基因;

在U3启动子前设计了BglII、NheI、SalI三个单酶切位点,poly-T尾巴之后设计了XhoI、XbaI、BamHI、KpnI单酶切位点;其中,BglII和BamHI,NheI和XbaI,SalI和XhoI是同尾酶;

3)、单个目的gRNA的构建:

在目标基因的基因组序列上找序列为目标序列;

设计两个互补DNA序列分别为:在正向序列前加GGCA,在反向互补序列前加AAAC;

SK-gRNA上有两个AarI酶切位点,用AarI酶切后,形成带有粘性末端的载体;将设计的靶序列正向及反向引物变性退火后,T4连接酶连入SK-gRNA,形成单个目的gRNA;

4)、多个gRNA的串联及最终双元表达载体的构建:

①、单个gRNA用KpnI和BglII双酶切SK-gRNA提供片段,连入载体pC1300-Cas9的KpnI和BamHI识别位点间,得到双元表达载体pC1300-Cas9-gRNA;

②、4个之内gRNA的一步法快速连接:

利用BglII和BamHI,NheI和XbaI,SalI和XhoI是同尾酶的属性,作为载体的用KpnI和XhoI进行酶切;提供片段的分别用SalI和XbaI,NheI和BamHI,BglII和KpnI进行酶切,进行4个之内gRNA的一步法快速聚合;最终将聚合好的片段用KpnI和BglII进行酶切并回收片段,连接到pC1300-Cas9的KpnI和BamHI位点间,构建最终双元表达载体,用于转基因制备植物多突变体。

2.根据权利要求1所述的植物多基因敲除载体的构建方法,其特征是:双元表达载体pC1300-Cas9-gRNA1-gRNA2gRNA3-gRNA4,1、2、3、4代表不同的敲除位点。

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