[发明专利]一种利用荧光PCR技术对小鼠的分型鉴定方法有效
申请号: | 201510520015.5 | 申请日: | 2015-08-21 |
公开(公告)号: | CN105177126B | 公开(公告)日: | 2018-12-04 |
发明(设计)人: | 肖君华;李雨;王茂春;仝莉;周宇荀 | 申请(专利权)人: | 东华大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/686 |
代理公司: | 上海泰能知识产权代理事务所 31233 | 代理人: | 黄志达 |
地址: | 201620 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 利用 荧光 pcr 技术 小鼠 鉴定 方法 | ||
1.一种利用荧光PCR技术对小鼠的分型鉴定方法,包括:
(1)利用Crispr/Cas9系统敲除mircoRNA的C57BL/6J小鼠,得到Founder小鼠;将Founder小鼠与C57BL/6J小鼠杂交,得到F1代小鼠,F1代杂合小鼠得到F2代;其中,mircoRNA为mircoRNA505;
(2)分别取上述F1、F2代小鼠尾组织,然后提取DNA;
(3)在Crispr/Cas9系统敲除的基因位点区域设计一对PCR引物,且在上游引物的5’端使用FAM荧光修饰,得到荧光引物;其中,引物为:L:5’AAACCAGCAAGTGTTGACGC3’;R:5’CCCTGTTTGTCACTTGCAGA3';
(4)将荧光引物对步骤(2)中的DNA进行PCR扩增,然后将PCR产物与分子内标混合,在测序仪上经过电泳分离,鉴定;其中,在测序仪上经过电泳分离为:在377测序仪上经过聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,测试仪功率为30W,分离时间为2h;分子内标为携带ROX的已知片段大小的DNA,其中已知片段大小的DNA的片段大小为79、105、131、151;
鉴定具体为:将测序仪上电泳分离的结果进行数据采集,然后对采集的数据进行分析,分析PCR产物检测峰的数目及位置,计算出PCR产物大小,进行鉴定;检测峰的数目:单峰为纯合,双峰为杂合;检测峰的位置:峰的位置代表产物片段大小;野生老鼠产物大小为112bp,检测峰位于右侧,为单峰;双敲小鼠产物大小为89bp检测峰位于左侧,为单峰;单敲小鼠产物大小为89bp,左侧峰,112bp为右侧峰,为双峰。
2.根据权利要求1所述的一种利用荧光PCR技术对小鼠的分型鉴定方法,其特征在于:所述步骤(3)中FAM为6’FAM。
3.根据权利要求1所述的一种利用荧光PCR技术对小鼠的分型鉴定方法,其特征在于:所述步骤(4)中PCR扩增具体为:3μLDNA加入到Taq酶体系中,其中Taq酶体系包含1.5μL200nM上下游引物、1.5μL 0.25mM的dNTP,5μL 10XPCR Buffer,1μL的1单位Taq酶,并使用矿物油覆盖;同时设阴性对照,反应程序为:95℃变性5min;94℃变性30s,56℃复性1min30s,72℃延伸1min,35个循环,72℃,10min。
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