[发明专利]用于分析核酸扩增反应的分析方法和系统有效
申请号: | 201510531061.5 | 申请日: | 2015-08-26 |
公开(公告)号: | CN105389479B | 公开(公告)日: | 2021-08-10 |
发明(设计)人: | R.诺贝尔 | 申请(专利权)人: | 霍夫曼-拉罗奇有限公司 |
主分类号: | G16B20/20 | 分类号: | G16B20/20 |
代理公司: | 北京坤瑞律师事务所 11494 | 代理人: | 封新琴 |
地址: | 瑞士*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 分析 核酸 扩增 反应 方法 系统 | ||
1.一种用于实时核酸扩增反应RNR的分析方法,该方法包括:
-对所述RNR的每个扩增反应循环获得分析物的荧光发射强度;
-创建增长曲线(200),所述增长曲线(200)指示RNR循环范围里的荧光发射强度,
-计算所述RNR循环范围里的组合阈值函数CTF,所述组合阈值函数CTF包含至少两个不同阈值水平,其中所述组合阈值函数CTF依赖于所述RNR的循环数目,所述组合阈值函数CTF从初始阈值水平(y1)转变成最终阈值水平(y2),所述初始阈值水平(y1)不同于所述最终阈值水平(y2),所述最终阈值水平(y2)是B+r·I,其中B是基线函数,所述基线是显示无信号增大的增长曲线的初始部分,r是正百分比参数,且I是截取外推至循环数目0,所述初始阈值水平(y1)是y(x)=B+p·G=B+p·(S-B),其中B是基线函数,S是增长曲线的饱和线,G是从基线至饱和线的增长,且p是介于0%和100%之间的参数,其中所述初始阈值水平(y1)高于所述最终阈值水平(y2),其中所述组合阈值函数选自包含下述的三种函数的组:
i.具有从初始阈值水平(y1)至最终阈值水平(y2)的线性转变的CTF,其依照
其中,x1是等于0或1的早期反应循环数目,x2是大于30的后期反应循环数目,y1是初始阈值水平,y2是最终阈值水平;
ii.具有从初始阈值水平(y1)至最终阈值水平(y2)的多项式转变的CTF,其依照
其中,p是固定多项式阶,其中p对于二次多项式函数是2;
iii.具有从初始阈值水平(y1)至最终阈值水平(y2)的指数转变的CTF,其依照
-测定所述RNR的量化循环数目(Cq),所述量化循环数目(Cq)指示增长曲线(200)的定量和/或定性分析结果为与所述增长曲线(200)与所述组合阈值函数CTF的交叉对应的循环数目。
2.根据权利要求1的分析方法,其中:
所述初始阈值水平(y1)具有起始点(T1),所述起始点(T1)具有的y-坐标高于所述最终阈值水平(y2)的终点(T2)的y-坐标,产生减少的组合阈值函数CTF。
3.根据权利要求1或2的分析方法,其中所述实时核酸扩增反应RNR是实时聚合酶链式反应PCR。
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