[发明专利]一种检测伪狂犬病毒GE基因的LAMP检测方法在审
申请号: | 201510563614.5 | 申请日: | 2015-09-07 |
公开(公告)号: | CN105112565A | 公开(公告)日: | 2015-12-02 |
发明(设计)人: | 李俊;郑书轩;王金宝;时建立;徐绍建;彭喆;刘畅;吴家强;于江;孙文博;杜以军 | 申请(专利权)人: | 山东省农业科学院畜牧兽医研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 北京市诚辉律师事务所 11430 | 代理人: | 唐宁 |
地址: | 250100 *** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 狂犬病毒 ge 基因 lamp 方法 | ||
1.一种用于快速检测猪伪狂犬病病毒的环介导等温扩增(Loop-mediatedisothermalamplification,LAMP)引物组,所述引物组的序列结构为:
正向外引物(F3):ACGAGCCCCGCTTCCA
反向外引物(B3):AGATGCAGGGCTCGTACA
正向内引物(FIP):AGACCACGCGCGCGGCATCAG-CTTCCACTCGCAGCTCTTCT
反向内引物(BIP):GAGAACTTCACCGCCACGCT-CGTAGTACAGCAGGCACCG。
2.根据权利要求1所述的LAMP引物,其特征在于,所述引物具有高度特异性,有效扩增猪伪狂犬病毒基因的扩增模板DNA浓度为10~1010个拷贝数/每ul。
3.权利要求1所述的LAMP引物组在制备检测猪伪狂犬病毒的试剂盒中的应用。
4.由权利要求1所述的LAMP引物组制备的检测猪伪狂犬病毒的试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒包括:
(1)所述的LAMP引物组;
(2)扩增靶标DNA所需必要的扩增制剂,所述的扩增制剂包括但不限于,DNA聚合酶,DNTP,以及用于DNA扩增的盐溶液;
(3)用于检测所需的检测制剂,所述的检测制剂优选为,核酸荧光显色剂。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒的检测应用包括如下步骤:
步骤(1)提取病料血清中的病毒DNA;
步骤(2)使用所述LAMP引物在LAMP反应体系中扩增病毒DNA;
步骤(3)LAMP反应结果检测。
6.根据权利要求5所述的试剂盒,其特征在于,
所述的步骤(1)的具体方法为:
1)取病料血清500μL于1.5mL离心管。向离心管中加入10%SDS溶液50μL,而后加入蛋白酶K(20mg/mL)10μL,混匀后置56℃水浴1.5-2h。
2)加入200μLTris平衡酚,充分混匀溶液,置高速离心机中4℃12000rpm离心15min。
3)取上清液于一新1.5mL离心管中,加入Tris平衡酚和氯仿各200μL,充分混匀,4℃12000rpm离心15min。
4)取上清液于一新离心管中,加入氯仿200μL,充分混匀,4℃12000rpm离心15min。
5)取上清液于一新离心管中,加入2倍上清液体积的已-20℃预冷的无水乙醇,于冰箱-20℃静置20min后,4℃12000rpm离心15min,弃掉上清液,此时会发现管底附着有透明粘性沉淀。
6)向离心管中加入1mL70%乙醇冲洗沉淀表面和管壁,4℃7500rpm离心5min,弃掉乙醇,用吸水纸吸走余下液体。
7)加入20μL灭菌水将沉淀溶解,置于-20℃保存备用;
所述步骤(2)的具体方法为:
(1)25μL的LAMP反应体系成分如下:
1)BstDNA聚合酶(8U/μL),1ul;
2)10×ThermoPol缓冲液(100mMKCl,100mM(NH4)SO4,200mMTris-HCl,20mMMgSO4,1%TritonX-100),2.5ul;
3)步骤(1)获得的DNA样品,2ul;
4)MgSO4(100nmol/μL),1ul、Betaine(5μmol/μL),5ul;
5)dNTP(25mmol/μL),5ul;
6)BIP&FIP引物(40uM),2ul、F3&B3引物(10uM),0.25ul
7)余量为灭菌超纯水。
(2)反应温度控制在65℃,扩增40-60min,80℃5min终止反应;
所述步骤(3)的具体方法为:
1)琼脂糖凝胶电泳、或2)SYBRGreenI染色法、或3)瞬时离心法;
所述的琼脂糖凝胶电泳法为:
取5μL扩增产物于1.5%琼脂糖凝胶中电泳,置凝胶成像系统下观察结果条带;
所述的SYBRGreenI染色法为:
向反应管中加入1μLSYBRGreenI核酸染料,观察溶液颜色变化;
所述的瞬时离心法为:
在反应结束后进行瞬时离心,通过有无沉淀判断反应结果。
7.根据权利要求4至6任一所述的试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒用于检测目标病料中的伪狂犬病毒。
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