[发明专利]一种棘腹蛙感染腐败希瓦氏菌的PCR检测试剂盒及检测方法在审
申请号: | 201510564192.3 | 申请日: | 2015-09-08 |
公开(公告)号: | CN105132554A | 公开(公告)日: | 2015-12-09 |
发明(设计)人: | 徐敬明;姜玉松;樊汶樵;吴宝红;李晓英 | 申请(专利权)人: | 重庆文理学院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04 |
代理公司: | 北京一格知识产权代理事务所(普通合伙) 11316 | 代理人: | 刘佳 |
地址: | 402160 *** | 国省代码: | 重庆;85 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 棘腹蛙 感染 腐败 希瓦氏菌 pcr 检测 试剂盒 方法 | ||
1.一种检测棘腹蛙感染腐败希瓦氏菌的PCR检测试剂盒,包括2倍反应混合缓冲液、Taq酶、上游引物S‐F:5’–CCCCTATCCTTATTTGCC–3’和下游引物S‐R:5’–CTAGCGATTCCGACTTCAT–3’。
2.如权利要求1所述的检测试剂盒,还包含阳性对照液和阴性对照液。
3.如权利要求2所述的检测试剂盒,还包含灭菌的ddH2O。
4.如权利要求1或2所述的检测试剂盒,所述2倍反应混合缓冲液1.0mL,包含以下成分:
5.如权利要求1或2所述的检测试剂盒,所述上游引物S‐F和下游引物S‐R的浓度各为10μM/L。
6.权利要求1或2所述的检测试剂盒,所述Taq酶为5U/μLTaq酶。
7.权利要求1或2所述的检测试剂盒,所述阳性对照液为感染腐败希瓦氏菌的棘腹蛙的基因组DNA;所述阴性对照液为ddH2O。
8.一种采用权利要求1或2所述的试剂盒检测棘腹蛙感染腐败希瓦氏菌的方法,包括以下步骤:
(1)棘腹蛙DNA的提取:
①取病蛙眼、口腔或胃,剪碎后置于匀浆器中,加入匀浆液后冰浴研磨,研磨碎裂后置离心管中;
②加入1%‐3%的β‐巯基乙醇溶液,混匀后60‐70℃水浴0.5‐1h,每隔3‐5分钟取出摇匀一次;
③10000‐15000rpm离心3‐7min,离心后,移出上清液液于另一无菌离心管中,弃沉淀;
④向上清液中加入等体积的按体积比20‐30:1的氯仿:异戊醇的混合溶剂,混匀后,8000‐12000rpm离心5‐15min,取上清液至另一无菌离心管中;
⑤加入等体积的氯仿,混匀后8000‐12000rpm离心5‐15min,再取上清液;
⑥向上清液中加入0.8‐1.2倍体积的2‐4MNaAc溶液,混匀后再加入1.5‐2.5倍体积预冷的无水乙醇,充分混匀后‐18℃以下放置30min以上;
⑦10000‐15000rpm离心3‐7min,弃上清液,所得DNA沉淀在室温下晾干;
⑧用70‐80%的乙醇对DNA沉淀进行洗涤,干燥后沉淀溶于TE中,加RNaseA,37℃消化20‐40min,得到棘腹蛙DNA后于‐20℃保存。
(2)PCR反应体系:采用20μL的PCR反应体系,在0.2mLPCR反应管内分别加入2倍反应混合缓冲液10μL,上游引物、下游引物各0.5μL,5U/μLTaqDNA聚合酶0.5μL,DNA模板1.0μL,用灭菌超纯水加至总体积,同时分别用阳性对照液和阴性对照液作为模板,设置阳性和阴性对照组,混合均匀后离心数秒,置于PCR反应仪上反应;
(3)PCR扩增产物的检测:PCR反应结束后,取10μL产物在1%琼脂糖凝胶(含溴化乙锭0.5μg/mL)上,使用0.5×TAE缓冲液进行电泳,在紫外透射仪下观察PCR产物,检查PCR产物的预期大小;
(4)结果与判定:在紫外灯下观察并与标准分子量相对照,若检测样品在237bp处出现明亮的条带,而阴性对照没有目的条带,则为腐败希瓦氏菌阳性;若阳性对照可见目的条带,而检测样品无目的条带出现,则为阴性,没有或不是所要检测的目的腐败希瓦氏菌。
9.如权利要求7所述的方法,所述PCR反应体系,其PCR反应条件为:95℃预变性5分钟;然后95℃变性30秒,56℃退火30秒,72℃延伸30秒,共循环30次;72℃延伸7分钟,最后4℃保存。
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