[发明专利]转基因玉米MON810双重数字PCR荧光定量检测方法在审
申请号: | 201510587904.3 | 申请日: | 2015-09-15 |
公开(公告)号: | CN105112539A | 公开(公告)日: | 2015-12-02 |
发明(设计)人: | 付伟;朱鹏宇;杜智欣;王晨光;魏霜;张亮亮;彭萱子;朱水芳 | 申请(专利权)人: | 中国检验检疫科学研究院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 王文君 |
地址: | 100029 北京*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 转基因 玉米 mon810 双重 数字 pcr 荧光 定量 检测 方法 | ||
1.用于转基因玉米MON810双重数字PCR荧光定量检测的引物和探针组合,其特征在于,所述引物和探针组合为:
外源基因正向引物:5'-TCGAAGGACGAAGGACTCTAACGT-3'
外源基因反向引物:5'-GCCACCTTCCTTTTCCACTATCTT-3'
外源基因探针:5'-FAM-AACATCCTTTGCCATTGCCCAGC-BHQ1-3'
内参基因hmga正向引物:5'-TTGGACTAGAAATCTCGTGCTGA-3'
内参基因hmga反向引物:5'-GCTACATAGGGAGCCTTGTCCT-3'
内参基因hmga探针:5'-VIC-CAATCCACACAAACGCACGCGTA-BHQ1-3'。
2.含有权利要求1所述引物和探针组合的转基因玉米MON810双重数字PCR荧光定量检测试剂盒。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括dNTPs、TaqDNA聚合酶、Mg2+、PCR反应缓冲液、标准阳性模板中的至少一种。
4.转基因玉米MON810双重数字PCR荧光定量检测方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:
1)提取待测样品的基因组DNA;
2)以提取的基因组DNA为模板,利用权利要求1所述的引物和探针组合,进行数字PCR扩增反应;
3)检测PCR扩增产物。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,步骤2)中数字PCR扩增反应的反应体系以4μl计为:基因组DNA1μl,225nM外源基因正、反向引物各0.04μl,225nM内参基因正、反向引物各0.04μl,50nM外源基因探针0.02μl,50nM内参基因探针0.02μl,2×MasterMix2μl,20×LoadingReagent0.4μl,ddH2O补足至4μl。
6.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,步骤2)中进行数字PCR扩增反应的程序为:50℃热激活300s;95℃预变性300s;95℃变性15s,60℃退火及延伸60s,共50个循环;在60℃下采集荧光信号。
7.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,在PCR芯片中进行数字PCR扩增反应。
8.根据权利要求4-7任一项所述的方法,其特征在于,步骤3)中检测PCR扩增产物具体如下:在数字PCR扩增反应结束后,记录各反应孔中外源基因和内参基因的荧光信号值,通过泊松分布公式计算各反应孔中外源基因与内参基因的拷贝数,通过两者的拷贝数之比得到转基因成分的绝对浓度。
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