[发明专利]三阴性乳腺癌转移相关易感基因TNF-α突变检测试剂盒及检测方法有效
申请号: | 201510618157.5 | 申请日: | 2015-09-25 |
公开(公告)号: | CN105368928A | 公开(公告)日: | 2016-03-02 |
发明(设计)人: | 李慧慧;孟雪;宋宝;翟侃;常春晓;刘聪;徐娜;商玉红 | 申请(专利权)人: | 山东省肿瘤医院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 济南泉城专利商标事务所 37218 | 代理人: | 张秀福 |
地址: | 250117 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 阴性 乳腺癌 转移 相关 基因 tnf 突变 检测 试剂盒 方法 | ||
1.一种三阴性乳腺癌转移相关易感基因TNF-α突变的检测试剂盒,其特征在于,包括如下组分:
10×PCR反应缓冲液1.0ul;
25mMMgCl2溶液0.5ul;
2.5mMdNTPMixture1.0ul;
5U/ulTaqDNA聚合酶0.25ul;
10uM引物F0.25ul;
10uM引物R0.25ul;
10×内切酶反应缓冲液2μl;
10U/μlNcoI内切酶0.5μl;
灭菌蒸馏水13.5ul;
所述引物F的碱基序列如SEQ:ID:NO:1所示;
所述引物R的碱基序列如SEQ:ID:NO:2所示。
2.根据权利要求1所述的三阴性乳腺癌转移相关易感基因TNF-α突变的检测试剂盒,其特征在于,具体检测步骤如下:
1)取三阴性乳腺癌患者外周血基因组DNA;
2)PCR反应:
反应体系总体积为10ul,包括10×PCR反应缓冲液1.0ul,25mMMgCl2溶液0.5ul,2.5mMdNTPMixture1.0ul,5U/ulTaqDNA聚合酶0.25ul,10uM特异性引物对F和R各0.25ul,灭菌蒸馏水6.0ul,DNA1.0ul;反应条件为95℃5分钟,此后进行35个循环的98℃10秒、55℃30秒、72℃30秒,最后一步为72℃5分钟;
3)限制性内切酶酶切
取步骤2)所得产物加入试剂盒中所包含10×内切酶反应缓冲液2μl,10U/μlNcoI内切酶0.5μl,去离子水7.5μl,在37℃条件下水浴1小时;
4)3%琼脂糖凝胶电泳检测上述所得酶切产物,根据电泳条带大小判断是否存在TNF-α308G>A遗传变异,判断方法如下:
(1)若rs1800629位点上两个等位基因均存在308G>A遗传变异,PCR产物进行电泳分析可见仅171bp处存在条带;
(2)若rs1800629位点上仅一个等位基因存在308G>A遗传变异,PCR产物进行电泳分析可见171bp、131bp处均存在条带;
(3)若rs1800629位点上并未存在308G>A遗传变异,PCR产物进行电泳分析仅在131bp处可见条带。
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