[发明专利]用于环境真菌生物多样性高通量测序的复合标签及其应用在审
申请号: | 201510628184.0 | 申请日: | 2015-09-28 |
公开(公告)号: | CN105331684A | 公开(公告)日: | 2016-02-17 |
发明(设计)人: | 高其康;李梅;楼兵干 | 申请(专利权)人: | 浙江大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 杭州天勤知识产权代理有限公司 33224 | 代理人: | 黄平英 |
地址: | 310027 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 环境 真菌 生物多样性 通量 复合 标签 及其 应用 | ||
1.一种用于环境真菌生物多样性高通量测序的复合标签,其特征在于,其碱基序列如如下序列编号NO.1~NO.48所示:
2.一种利用权利要求1所述复合标签进行超高通量基因测序的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)提取每一个样本的总DNA;
(2)对每一个样本,从权利要求1中所示48对且未被选择过的序列中选择任一一对序列作为引物,对对应样本的总DNA进行扩增;
(3)对每一个样本的扩增产物进行电泳检测,对扩增产物进行纯化回收;
(4)对每个样本纯化回收后的产物紫外分光光度计精确定量;
(5)将所有样本等量混合后建立一个测序文库;
(6)对所建测序文库进行高通量测序。
3.根据权利要求2所述方法,其特征在于,所述样本为含有真菌的样本。
4.根据权利要求2所述方法,其特征在于,对对应样本的总DNA进行扩增的PCR扩增体系为:
50ng样本总DNA,4μLMg2+,5μL10×Buffer,4μL浓度为5nmoldNTP,1.5UTaq酶,浓度为10pmol引物各1.5μL,补水至50μL。
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