[发明专利]乳腺癌联合诊断标志物及检测试剂盒有效
申请号: | 201510632771.7 | 申请日: | 2015-09-29 |
公开(公告)号: | CN105256014B | 公开(公告)日: | 2020-04-03 |
发明(设计)人: | 王义明;罗国安 | 申请(专利权)人: | 王义明 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 北京同辉知识产权代理事务所(普通合伙) 11357 | 代理人: | 刘洪勋;魏忠晖 |
地址: | 100083 北京*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 乳腺癌 联合 诊断 标志 检测 试剂盒 | ||
1.RECQL、RECQL4及RECQL5基因的mRNA表达作为联合标志物在制备乳腺癌检测和/或疗效评价试剂中的应用。
2.乳腺癌检测和/或疗效评价的特异性RT-PCR引物和探针,其特征在于,包括RECQL、RECQL4及RECQL5基因的特异性扩增引物及探针,探针的核苷酸序列5’端连接有荧光报告基团,非5’端连接有荧光淬灭基团,其中
RECQL扩增引物组的核苷酸序列如SEQ ID NO1~2所示,
RECQL特异性探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示;
RECQL4扩增引物组的核苷酸序列如SEQ ID NO:4 ~5所示,
RECQL4特异性探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:6所示;
RECQL5扩增引物组的核苷酸序列如SEQ ID NO:7 ~8所示,
RECQL5特异性探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:9所示。
3.根据权利要求2所述的乳腺癌检测和/或疗效评价的特异性RT-PCR引物和探针,其特征在于,还包括内参基因GAPDH的特异性扩增引物及探针,
GAPDH扩增引物组的核苷酸序列如SEQ ID NO:10~11所示,
GAPDH特异性探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:12所示;
探针的核苷酸序列5’端连接有荧光报告基团,非5’端连接有荧光淬灭基团。
4.根据权利要求2或3所述的乳腺癌检测和/或疗效评价的特异性RT-PCR引物和探针,其特征在于,探针的核苷酸序列5’端连接有荧光报告基团FAM,3’端连接有荧光淬灭基团TAMRA。
5.一种乳腺癌检测和/或疗效评价试剂盒,其特征在于,包括权利要求2~4任一所述的检测乳腺癌的特异性RT-PCR引物和探针。
6.根据权利要求5所述的乳腺癌检测和/或疗效评价试剂盒,其特征在于,还包括阳性模板,阳性模板包括纯化后的:RECQL基因扩增产物、RECQL4基因扩增产物、RECQL5基因扩增产物和GAPDH基因扩增产物。
7.根据权利要求6所述的乳腺癌检测和/或疗效评价试剂盒,其特征在于,分为RECQL、RECQL4、RECQL5和GAPDH这4个基因的实时荧光定量PCR反应体系和这4个基因的阳性模板体系,其中,
每个基因的实时荧光定量PCR反应体系19.0μL,包括PCR反应缓冲液10μL、浓度10μM的该基因扩增引物各0.8μL、浓度2μM的该基因特异性探针1.0μL和RNase-free water7.2μL;
每个基因的阳性模板体系包括浓度为1×109拷贝/μL的纯化后的该基因扩增产物。
8.RECQL、RECQL4及RECQL5基因的mRNA表达作为联合标志物在制备乳腺癌检测和/或疗效评价试剂中的应用,其特征在于,所述试剂采用权利要求6或7所述的乳腺癌检测和/或疗效评价试剂盒,试剂盒的使用包括以下步骤:
将RECQL、RECQL4、RECQL5和GAPDH这4个基因的阳性模板进行梯度稀释后加入实时荧光定量PCR反应体系,进行荧光定量PCR反应,根据稀释拷贝数和扩增Ct值,绘制每个基因的定量标准曲线;
待检测样本提取总RNA后逆转录为cDNA,以该cDNA为荧光定量PCR模板,加入实时荧光定量PCR反应体系后,进行荧光定量PCR反应,所得扩增Ct值带入相应基因的定量标准曲线,得到样本中该基因的初始表达量;
待检测样本的测定结果用该样本的内参基因GAPDH的结果进行归一化处理,处理后按方程y=x1+42.016×x2+7.87×x3计算RECQL、RECQL4和RECQL5三个标志物基因的联合预测因子,其中y表示联合预测因子,x1表示样本RECQL基因的表达量,x2表示样本RECQL4基因的表达量,x3表示样本RECQL5基因的表达量;
y小于0.006时待检测样本为阳性,y大于0.006时待检测样本为阴性。
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