[发明专利]一种食用菌菌丝快速PCR方法在审
申请号: | 201510641076.7 | 申请日: | 2015-09-30 |
公开(公告)号: | CN105200139A | 公开(公告)日: | 2015-12-30 |
发明(设计)人: | 汪虹;陈明杰;赵妍;冯爱萍;辛苗苗 | 申请(专利权)人: | 上海市农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12R1/645 |
代理公司: | 上海泰能知识产权代理事务所 31233 | 代理人: | 黄志达 |
地址: | 201106 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 食用菌 菌丝 快速 pcr 方法 | ||
技术领域
本发明属于快速PCR领域,特别涉及一种食用菌菌丝快速PCR方法。
背景技术
聚合酶链式反应简称PCR反应,是体外酶促合成特异DNA片段的一种方法,在分子生物学中有广泛的应用。
通常PCR反应之前首先需要提取基因组DNA作为扩增模板,食用菌菌丝基因组DNA提取方法常用CTAB法,需要的菌丝量大,耗时。尽管近年来不断有公司开发出快速PCR试剂盒,但主要针对植物和动物样品,用于食用菌菌丝直接扩增时,经常出现扩增不出特异性条带或对照也扩出条带等问题,无法应用于食用菌菌丝快速PCR扩增。
发明内容
本发明所要解决的技术问题是提供一种食用菌菌丝快速PCR方法,该方法所需菌丝量少,无需耗时进行基因组DNA提取,具有操作简便,检测时间短,准确性高,稳定性和重复性好的优点;可以利用少量菌丝进行PCR扩增,获得所需的目的DNA片段,缩短试验进程,适用于大批量样品的PCR扩增。
本发明的一种食用菌菌丝快速PCR方法,包括:
(1)用移液器吸取裂解液置于PCR管中,用灭菌牙签挑取预先培养的食用菌菌丝置于裂解液中离心,振荡,再离心;
(2)以上述得到的菌丝裂解液为模板进行PCR扩增,PCR反应体系:12.5μL扩增混合液,待扩增基因特异性引物对各0.5μL,菌丝裂解液0.5μL,ddH2O11μL;PCR反应条件:95℃5min;95℃30s,(引物Tm值-5)℃30s,72℃1min,35个循环;72℃10min;
(3)取上述PCR扩增产物与加样缓冲液混匀,点样于琼脂糖凝胶上,于缓冲液中电泳,电泳结束后,用EB染色,然后拍照,即可。
所述步骤(1)中的裂解液占PCR管体积的1/10。
所述步骤(3)中的PCR扩增产物与加样缓冲液的体积比为5:1。
所述步骤(3)中的琼脂糖凝胶浓度为1.5%。
所述步骤(3)中的电泳电压为5V/cm。
本发明不需要提取食用菌基因组DNA,筛选获得裂解液简单快速处理少量菌丝样品作为模板,利用筛选获得的PCR扩增试剂盒即可进行PCR扩增反应,获得所需的目的DNA片段。
有益效果
本发明所需菌丝量少,无需耗时进行基因组DNA提取,具有操作简便,检测时间短,准确性高,稳定性和重复性好的优点;可以利用少量菌丝进行PCR扩增,获得所需的目的DNA片段,缩短试验进程,适用于大批量样品的PCR扩增。
附图说明
图1为草菇菌株交配型基因特异条带扩增图;其中,M为Marker;1为草菇菌株V23;2为对照。
图2为香菇菌株微管蛋白基因特异条带扩增图;其中,M为Marker;1为香菇菌株135;2为对照。
具体实施方式
下面结合具体实施例,进一步阐述本发明。应理解,这些实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。此外应理解,在阅读了本发明讲授的内容之后,本领域技术人员可以对本发明作各种改动或修改,这些等价形式同样落于本申请所附权利要求书所限定的范围。
实施例1
(1)菌丝培养:
草菇菌株V23接种PDA试管,适宜温度培养。
(2)PCR反应模板制备:
移液器吸取50μL裂解液置于0.5mLPCR管中,用灭菌竹制牙签挑取少量菌丝置于裂解液中,短暂离心,混匀器上振荡1分钟,短暂离心,以该裂解液为模板。
(3)PCR反应体系及条件
扩增反应体系(25μL):12.5扩增混合液,待扩增基因特异性引物对各0.5μL,菌丝裂解液0.5μL,ddH2O11μL。PCR反应条件:95℃5min;95℃30second,55℃30second,72℃1min,35个循环;72℃10min。
(4)电泳检测
取上述PCR扩增产物5μL,与1μL加样缓冲液混匀,点样于1.5%的琼脂糖凝胶上,于0.5XTBE缓冲液中,5V/cm电压下电泳,电泳结束后,用EB染色,然后在凝胶成像仪上拍照。
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