[发明专利]检测RNA G-四链体的方法有效
申请号: | 201510657843.3 | 申请日: | 2015-10-13 |
公开(公告)号: | CN106568732B | 公开(公告)日: | 2019-10-15 |
发明(设计)人: | 唐亚林;许淑娟;李骞;孙红霞;管爱娇;王立霞;张素格;史运华 | 申请(专利权)人: | 中国科学院化学研究所 |
主分类号: | G01N21/33 | 分类号: | G01N21/33;G01N21/64;G01N21/78 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 李志东 |
地址: | 100190 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 混合溶液 四链体 待测样品 光谱分析 检测RNA 紫外吸收光谱分析 光谱分析结果 准确度 颜色观察 灵敏度 种检测 染料 荧光 | ||
1.一种确定待测样品中是否存在RNA G-四链体的方法,其特征在于,包括:
(1)将所述待测样品溶解在Tris缓冲液中,以便获得溶液A,所述Tris缓冲液含有钾离子,所述钾离子的浓度是40mM,所述Tris缓冲液pH为7.0~8.0;将菁染料与甲醇和Tris缓冲液混合,以便获得溶液B;将所述溶液A和溶液B混合并在避光条件下反应5~10小时,以便获得混合溶液,其中,所述混合溶液中RNA与所述菁染料的分子摩尔比为(0.5~4):1,所述待测样品被预先确定含有RNA;
(2)对所述混合溶液进行紫外吸收光谱分析;以及
(3)基于所述紫外吸收光谱分析结果,确定所述待测样品中是否存在RNA G-四链体,其中,所述紫外吸收光谱分析结果中菁染料聚集体特征峰小于0.01是所述待测样品中含有RNA G-四链体的指示,所述菁染料聚集体特征峰在628nm~668nm。
2.一种确定待测样品中是否存在RNA G-四链体的方法,其特征在于,包括:
(1)将所述待测样品溶解在Tris缓冲液中,以便获得溶液A,所述Tris缓冲液含有钾离子,所述钾离子的浓度是40mM,所述Tris缓冲液pH为7.0~8.0;将菁染料与甲醇和Tris缓冲液混合,以便获得溶液B;将所述溶液A和溶液B混合并在避光条件下反应5~10小时,以便获得混合溶液,其中,所述混合溶液中RNA与所述菁染料的分子摩尔比为(0.5~4):1,所述待测样品被预先确定含有RNA;
(2)对所述混合溶液进行紫外吸收光谱分析;以及
(3)基于所述紫外吸收光谱分析结果,确定所述待测样品中是否存在RNA G-四链体,其中,所述紫外吸收光谱分析结果中菁染料聚单体特征峰大于0.05是所述待测样品中含有RNA G-四链体的指示,所述菁染料单体特征峰在558nm~598nm。
3.一种确定待测样品中是否存在RNA G-四链体的方法,其特征在于,包括:
(1)将所述待测样品溶解在Tris缓冲液中,以便获得溶液A,所述Tris缓冲液含有钾离子,所述钾离子的浓度是40mM,所述Tris缓冲液pH为7.0~8.0;将菁染料与甲醇和Tris缓冲液混合,以便获得溶液B;将所述溶液A和溶液B混合并在避光条件下反应5~10小时,以便获得混合溶液,其中,所述混合溶液中RNA与所述菁染料的分子摩尔比为(0.5~4):1,所述待测样品被预先确定含有RNA;
(2)对所述混合溶液进行荧光光谱分析;以及
(3)基于所述荧光光谱分析结果,确定所述待测样品中是否存在RNA G-四链体,其中,所述荧光光谱分析结果中菁染料单体特征峰与预定参数相比高200~1200倍是所述待测样品中含有RNAG-四链体的指示,
所述预定参数是利用菁染料进行平行试验确定的,所述菁染料单体特征峰在575nm~615nm。
4.一种确定待测样品中是否存在RNA G-四链体的方法,其特征在于,包括:
(1)将所述待测样品溶解在Tris缓冲液中,以便获得溶液A,所述Tris缓冲液含有钾离子,所述钾离子的浓度是40mM,所述Tris缓冲液pH为7.0~8.0;将菁染料与甲醇和Tris缓冲液混合,以便获得溶液B;将所述溶液A和溶液B混合并在避光条件下反应5~10小时,以便获得混合溶液,其中,所述混合溶液中RNA与所述菁染料的分子摩尔比为(0.5~4):1,所述待测样品被预先确定含有RNA;
(2)观察所述混合溶液的颜色,确定所述待测样品中是否存在RNA G-四链体,其中,所述混合溶液的颜色为粉红色是所述待测样品中含有RNA G-四链体的指示。
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