[发明专利]中国人群肥胖易感基因SNP分型用试剂盒及其使用方法在审
申请号: | 201510671511.0 | 申请日: | 2015-10-16 |
公开(公告)号: | CN105296619A | 公开(公告)日: | 2016-02-03 |
发明(设计)人: | 严提珍;唐宁;曾定元;李哲涛;李伍高;罗世强;王秋华;钟青燕;许泽辉;黄际卫 | 申请(专利权)人: | 柳州市妇幼保健院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 柳州市荣久专利商标事务所(普通合伙) 45113 | 代理人: | 韦微 |
地址: | 545001 广*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 中国 人群 肥胖 基因 snp 分型用 试剂盒 及其 使用方法 | ||
1.一种中国人群肥胖易感基因SNP分型用试剂盒,其特征在于:该试剂盒包括以下内容:
(1)PCR反应试剂:包括10×PCR缓冲液、Mg2+离子、底物dNTP、FastTaq酶,SNaPshot混合液;
(2)按一定比例混合的针对10个肥胖易感基因11个区段进行多重PCR扩增的正向引物和反向引物;
(3)按一定比例混合的针对10个肥胖易感基因12个SNP位点的PCR延伸引物;
(4)PCR产物纯化试剂:包括核酸外切酶、虾-碱性磷酸酶及其配套的缓冲液;
(5)对照标本:包括单个SNP位点纯合、杂合突变的阳性对照标本、阴性对照标本;
所述试剂盒以FTO基因rs9939609位点和rs8050136位点、LEPR基因rs1137100位点、APOE基因rs429358位点和rs7412位点、MC4R基因rs17782313位点、UCP2基因rs660339位点、ADRB3基因rs4994位点、PPARγ2基因rs1801282位点、GNPDA2基因rs10938397位点、KCTD15基因rs29941位点、NEGR1基因rs3101336位点共12个位点为检测对象,针对每个SNP位点的突变分别设计出扩增引物和延伸引物,针对各个SNP位点进行多重PCR扩增和标记延伸,通过毛细管电泳分析,同时获得12个SNP位点的基因型;
所述FTO基因rs9939609位点扩增的正向引物和反向引物是5’-CTGGCTCTTGAATGAAATAGGA-3’和5’-GTCACACTCAGCCTCTCTACCA-3’;
所述FTO基因rs8050136位点扩增的正向引物和反向引物是5’-TGTGACAGTGCCAGCTTCAT-3’和5’-CACCAAGATGGTCATGTCTGAT-3’;
所述LEPR基因rs1137100位点扩增的正向引物和反向引物是5’-TTGCCTGCTGGACTCTCAA-3’和5’-AGAGATATTCCTTGCCTGAAGA-3’;
所述APOE基因rs429358位点扩增的正向引物和反向引物与所述APOE基因rs7412位点扩增的正向引物和反向引物相同,均是5’-CTGATGGACGAGACCATGAAG-3’和5’-TCGGCGTTCAGTGATTGTC-3’;
所述MC4R基因rs17782313位点扩增的正向引物和反向引物是5’-AGGCTCTGCTCTGTGTCTCTT-3’和5’-CTTCTGGAGGCAGGTTCTGT-3’;
所述UCP2基因rs660339位点扩增的正向引物和反向引物是5’-CATCGCAGATCTCATCACCT-3’和5’-TGCTCCATACTCACGCTCAG-3’;
所述ADRB3基因rs4994位点扩增的正向引物和反向引物是5’-CTCTCATGCCTTGCTGTC-3’和5’-GGTTGGTCACAGCCAGGTA-3’;
所述PPARγ2基因rs1801282位点扩增的正向引物和反向引物是5’-GACAGTGCCAGCCAATTCA-3’和5’-TGAACGCGATAGCAACGAG-3’;
所述GNPDA2基因rs10938397位点扩增的正向引物和反向引物是5’-TCTGTGCAGAGATGGCTGAT-3’和5’-GTGGTGATTCCACTGGCATA-3’;
所述KCTD15基因rs29941位点扩增的正向引物和反向引物是5’-TCATGCCTGGATGCACAAC-3’和5’-GATCTCACAACCAGCGAGTTC-3’;
所述NEGR1基因rs3101336位点扩增的正向引物和反向引物是5’-CCACGTAAAAGCCTGTCAGA-3’和5’-TGACCAGGGATGGAGCTATG-3’;
所述FTO基因rs9939609位点的延伸引物是(T)13AGAGACTATCCAAGTGCATCAC;
所述FTO基因rs8050136位点的延伸引物是(T)22TTGCCCACTGTGGCAAT;
所述LEPR基因rs1137100位点的延伸引物是(T)23TGCAGACAACATTGAAGGAA;
所述APOE基因rs429358位点的延伸引物是(T)30CGGACATGGAGGACGTG;
所述APOE基因rs7412位点的延伸引物序列是(T)34CCGATGACCTGCAGAAG;
所述MC4R基因rs17782313位点的延伸引物是(T)33TAAAGCAGGAGAGATTGTATCC;
所述UCP2基因rs660339位点的延伸引物是(T)43CCAGTGCGCGCTACAG;
所述ADRB3基因rs4994位点的延伸引物是(T)44GTCTGGAGTCTCGGAGTCC;
所述PPARγ2基因rs1801282位点的延伸引物是(T)46CTGGGAGATTCTCCTATTGAC;
所述GNPDA2基因rs10938397位点的延伸引物是(T)49TGCTAAGAACATTCTTGAAAAC;
所述KCTD15基因rs29941位点的延伸引物是(T)55TGACCTCTGCAGACCTAGGA;
所述NEGR1基因rs3101336位点的延伸引物是(T)56AAGAAAGCAATGACTGAACTTAG。
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