[发明专利]一种检测西瓜cDNA样品中是否有基因组DNA污染的方法在审
申请号: | 201510678873.2 | 申请日: | 2015-10-19 |
公开(公告)号: | CN105219861A | 公开(公告)日: | 2016-01-06 |
发明(设计)人: | 别之龙;孔秋生;曹蕾;高凌云;刘朋;刘越 | 申请(专利权)人: | 华中农业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 武汉开元知识产权代理有限公司 42104 | 代理人: | 徐绍新 |
地址: | 430070 湖*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 西瓜 cdna 样品 是否 基因组 dna 污染 方法 | ||
1.一种检测西瓜cDNA样品中是否有基因组DNA污染的方法,其特征在于:
1)根据西瓜基因的结构和序列信息在相邻两个外显子上分别设计正向和反向引物;
2)提取西瓜的RNA,反转录成cDNA,之后以cDNA为模板,用步骤1)设计的引物进行PCR扩增,并采用琼脂糖凝胶电泳方法检测扩增产物,如果扩增产物中出现一条长于目标产物的片段,则表明cDNA样品中有基因组DNA的污染,如仅扩增出目标片段,则表明cDNA样品中无基因组DNA的污染。
2.一种利用西瓜DNAJ基因检测西瓜果实cDNA样品中是否有基因组DNA污染的方法,其特征包括以下步骤:
1)根据西瓜DNAJ基因的结构和序列信息在第1和第2两个相邻外显子上分别设计正向和反向引物;
2)提取西瓜的RNA,反转录成cDNA,之后以cDNA为模板,用步骤1)设计的引物进行PCR扩增,并采用琼脂糖凝胶电泳方法检测扩增产物。如果扩增产物中出现一条长于87bp的片段,则表明cDNA样品中存在有基因组DNA的污染,如仅扩增出87bp的片段,则表明cDNA样品中无基因组DNA污染。
3.如权利要求2所述的利用西瓜DNAJ基因检测果实cDNA样品中是否有基因组DNA污染的方法,其特征在于:
所述正向和反向引物的核苷酸序列分别是:
正向引物序列:CCGCTATCAAGAACCATCCT
反向引物序列:CTGGATCACTCAGCACCTCA。
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