[发明专利]一种简便、快速、低成本的Hi-C文库构建方法

权利要求书

1.一种构建Hi-C文库的方法，该方法包括下述步骤：

步骤B：获得被固定化的染色质；所述被固定化的染色质的量为1ng～1,000,000ng，以裸DNA计；

步骤C：对所述步骤B中获得的被固定化的染色质进行消化，得到被固定化的染色质片段；

步骤D：将所述步骤C中得到的被固定化的染色质片段直接进行重新连接，得到重新连接的被固定化的染色质片段；

步骤E：使所述步骤D中得到的重新连接的被固定化的染色质片段解除固定化，释放DNA片段；以及

步骤G：以所述步骤E中释放的DNA片段作为待测序DNA片段，构建测序用DNA文库。

2.根据权利要求1所述的构建Hi-C文库的方法，其还包括：

在所述步骤E之后进行的步骤F：对所述步骤E中释放的DNA片段进一步片段化，得到更小的DNA片段；

且在所述步骤G中以所述更小的DNA片段作为待测序DNA片段，构建测序用DNA文库。

3.根据权利要求1所述的方法，其中，所述步骤C中使用脱氧核糖核酸酶对所述被固定化的染色质进行消化。

4.根据权利要求3所述的方法，其中，所述脱氧核糖核酸酶是Ⅰ型限制性内切酶、Ⅱ型限制性内切酶或Ⅲ型限制性内切酶。

5.根据权利要求1所述的方法，其中，所述步骤D中采用粘末端连接或平末端连接方法将所述步骤C中得到的被固定化的染色质片段进行重新连接。

6.根据权利要求2所述的方法，其中，所述步骤F中采用超声打断法、转座酶法、内切酶酶切法或液压剪切法将所述步骤E中释放的DNA片段片段化。

7.根据权利要求2所述的方法，其中，所述步骤F中得到的更小的DNA片段的大小为50～1000bp。

8.根据权利要求1所述的方法，其还包括：

步骤A：获取染色质被固定化的细胞；且

在所述步骤B中，裂解所述步骤A中获取的细胞，获得被固定化的染色质。

9.根据权利要求8所述的方法，其中，所述染色质被固定化的细胞是1万～10亿个细胞。

10.根据权利要求8所述的方法，其中，所述染色质被固定化的细胞是2500万～1亿个细胞。

11.一种测定在空间上相互作用的染色质区域的方法，该方法包括：

采用权利要求1～10中任一项所述的方法构建Hi-C文库；以及

对所述Hi-C文库进行测序，并将所获得信息与染色质DNA一级序列信息进行比对。