[发明专利]含反义碱基的探针法实时荧光PCR在审
申请号: | 201510684747.8 | 申请日: | 2015-10-22 |
公开(公告)号: | CN106609296A | 公开(公告)日: | 2017-05-03 |
发明(设计)人: | 岳素文;何玉贵;江洪 | 申请(专利权)人: | 北京泰格瑞分子检验有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
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地址: | 102209 北京市昌*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 反义 碱基 探针 实时 荧光 pcr | ||
1.含反义碱基的探针法实时荧光PCR,其特征在于,所选的TaqMan及MGB探针离5’端5至20个碱基的中部序列中引入1至5个反义2’-O-Methyl碱基或2’-F-RNA碱基;其关键特征在于中部含反义碱基的寡核苷酸荧光TaqMan/MGB探针保留其5’端荧光基团标记的正常碱基序列仍旧能被Taq聚合酶5’外切酶活性所识别、水解;但探针失去了作为PCR扩增模板作用,引物非特异结合探针序列后Taq聚合酶不能识别反义碱基的模板而不能延伸、扩增,从而减少了内源性的引物-探针的聚合非特异性扩增。
2.根据权利要求1所述的含反义碱基的探针法实时荧光PCR,其特征在于,所述的改良探针法实时荧光PCR采用中部6-8个碱基同序的引物对以减少引物二聚体PD程度,从而减少对靶扩增的竞争性抑制,提高灵敏度。
3.根据权利要求1所述的含反义碱基的探针法实时荧光PCR,其特征在于,所述的改良探针法实时荧光PCR探针3’末端添6-8个与其5’端反向互补的碱基序列,再标记淬灭基团,增加自身结合,而即降低荧光反应基线,又减少与引物结合的概率。
4.根据权利要求1所述的含反义碱基的探针法实时荧光PCR,其特征在于,所述的PCR反应液加等体积的矿物油单独使用,封闭反应液,不联用热盖条件。
5.根据权利要求1所述的含反义碱基的探针法实时荧光PCR,其特征在于,所选的TaqMan/MGB探针离5’端10-15个碱基的中部序列中引入1至3个反义2’-O-Methyl碱基或2’-F-RNA碱基。
6.根据权利要求1所述的含反义碱基的探针法实时荧光PCR,其特征在于,2.5U/ul Taq聚合酶加入0.1-2U/ul的UDG酶,消除PCR产物气雾胶的可能交叉污染。
7.根据权利要求1所述的含反义碱基的探针法实时荧光PCR,其特征在于,所述的含反义碱基的探针法实时荧光PCR技术应用试剂盒,成份包括:核酸提取试剂,底物dNTPs,Taq聚合酶及其缓冲液,UDG酶,荧光探针,引物,去离子水。
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