[发明专利]一种冠状动脉疾病风险评估试剂盒及风险评估方法有效

专利信息
申请号: 201510696497.X 申请日: 2015-10-23
公开(公告)号: CN106609300B 公开(公告)日: 2020-06-26
发明(设计)人: 周高英;高鹏;张淑丽 申请(专利权)人: 北京爱普益医学检验中心有限公司
主分类号: C12Q1/6869 分类号: C12Q1/6869
代理公司: 北京品源专利代理有限公司 11332 代理人: 孟金喆
地址: 100176 北京市大兴区*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 冠状动脉 疾病 风险 评估 试剂盒 方法
【权利要求书】:

1.一种心电检测装置,其特征在于,所述装置包括:

含RNA酶抑制剂的抗凝管、外周血RNA提取试剂盒、RNA反转录试剂盒以及高通量测序平台;

通过所述含RNA酶抑制剂的抗凝管抽取外周血作为样本;

通过所述外周血RNA提取试剂盒提取所述样本中的外周血RNA;

通过所述RNA反转录试剂盒对所述外周血RNA进行反转录并构建cDNA文库;

通过所述高通量测序平台,对所述cDNA文库进行高通量测序得到测序序列,

将所述测序序列与人类RNA基因组数据库进行序列比对得到唯一比对上目的基因的测定序列,

通过100-(唯一比对上单一基因的测定序列数/唯一比对上目的基因的测定序列总数)*10000得到基因表达量公式,

将每个基因代入所述基因表达量公式计算得到每个基因的基因表达量,

通过将每个基因的基因表达量代入冠脉狭窄评分公式计算冠脉狭窄评分,

判断所述冠脉狭窄评分与0的大小,若所述冠脉狭窄评分小于0,则没有冠状动脉疾病的患病风险。

2.根据权利要求1所述的装置,其特征在于,RNA反转录试剂盒具体用于,对所述外周血RNA反转录后得到的cDNA扩增富集得到全长cDNA;

将所述全长cDNA破碎成片段;

对所述片段进行筛选得到200bp范围的cDNA片段;

对所述200bp范围的cDNA片段进行平末端修复并加接头,然后进行PCR扩增,得到所述cDNA文库。

3.根据权利要求1所述的装置,其特征在于,所述人类RNA基因组数据库包括repeatmarker数据库、Genbank数据库、Rfam(10.1)数据库、UCSC数据库和piRNA数据库中的一种或多种。

4.根据权利要求1所述的装置,其特征在于,所述唯一比对上目的基因的测定序列包括AF28、AQP9、CASP5、CD3D、CD79B、CLEC4E、HNRNPF、IL18RAP、IL8RB、KCNE3、KLRC4、NCF4、RPL28、S100A12、S100A8、SLAMF7、SPIB、TFCP2、TLR4、TMC8、TNFAIP6、TNFRSF10C。

5.根据权利要求1所述的装置,其特征在于,所述冠脉狭窄评分公式包括:

1)定义Norm1=RPL28=22.13;

2)定义Norm2=(0.5*HNRPF+0.5*TFCP2);

3)定义NKup=(0.5*SLAMF7+0.5*KLRC4)4);

4)定义Tcell=(0.5*CD3D+0.5*TMC8);

5)定义Bcell=(2/3*CD79B+1/3*SPIB);

6)定义Neut=(0.5*AQP9+0.5*NCF4);

7)定义Nup=(1/3*CASP5+1/3*IL18RAP+1/3*TNFAIP6);

8)定义Ndown=(0.25*IL8RB+0.25*TNFRSF10C+0.25*TLR4+0.25*KCNE3);

9)定义SCA1=(1/3*S100A12+1/3*CLEC4E+1/3*S100A8);

10)定义AF2=AF289562;

11)定义女SEX=0,男SEX=1;

12)定义Intercept女:INTERCEPT=1.821+0.123*(年龄-60),结果为负则设为0;

Raw Score=INTERCEPT-0.755*(Nup-Ndown)-0.308*SEX*(SCA1-Norm1)-0.548*(1-SEX)*(SCA1-Neut)-0.406*(NKup-Tcell)-0.137*(Bcell-Tcell)-0.482*SE X-0.246(AF2-Norm2);

Final Score=RawScore*40/4.52。

6.根据权利要求1所述的装置,其特征在于,所述外周血样本在室温保存不超过5天。

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