[发明专利]一种副溶血弧菌、美人鱼发光杆菌和鰤诺卡氏菌的检测引物组、检测试剂盒和检测方法有效
申请号: | 201510733840.3 | 申请日: | 2015-11-02 |
公开(公告)号: | CN105176997A | 公开(公告)日: | 2015-12-23 |
发明(设计)人: | 许海东;郭志勋;陈日和;冯娟;苏友禄;郑维谦 | 申请(专利权)人: | 深圳市富炜城投资有限公司;中国水产科学研究院南海水产研究所 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68 |
代理公司: | 深圳市远航专利商标事务所(普通合伙) 44276 | 代理人: | 田志远 |
地址: | 518000 广东省深圳市盐*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 溶血 弧菌 美人鱼 发光 杆菌 鰤诺卡氏菌 检测 引物 试剂盒 方法 | ||
1.一种副溶血弧菌、美人鱼发光杆菌和鰤诺卡氏菌的检测引物组,其特征在于,包括引物对V.pa、引物对N.se和引物对P.da;其中,所述引物对V.pa包括核苷酸序列如SEQIDNO.1所示的V.pa-F和核苷酸序列如SEQIDNO.2所示的V.pa-R;所述引物对N.se包括核苷酸序列如SEQIDNO.3所示的N.se-F和核苷酸序列如SEQIDNO.4所示的N.se-R;所述引物对P.da包括核苷酸序列如SEQIDNO.5所示的P.da-F和核苷酸序列如SEQIDNO.6所示的P.da-F。
2.一种副溶血弧菌、美人鱼发光杆菌和鰤诺卡氏菌的检测试剂盒,其特征在于,包括权利要求1所述检测引物组。
3.根据权利要求2所述副溶血弧菌、美人鱼发光杆菌和鰤诺卡氏菌的检测试剂盒,其特征在于,还包括蛋白酶K、SDS溶液、酚-氯仿-异戊醇混合溶液、异丙醇、体积浓度为70%的乙醇、TE缓冲液、CTAB的NaCl溶液、阳性对照品和PCRDsMix;所述酚-氯仿-异戊醇混合溶液中酚、氯仿和异戊醇的体积比为25:24:1;所述CTAB的NaCl溶液为将CTAB溶于0.5mol/L的NaCl溶液中,CTAB和所述NaCl溶液的质量体积比为1:20;所述阳性对照品包括副溶血弧菌、美人鱼发光杆菌和鰤诺卡氏菌的DNA模板。
4.根据权利要求3所述副溶血弧菌、美人鱼发光杆菌和鰤诺卡氏菌的检测试剂盒,其特征在于,所述检测引物组中的引物浓度均为10μM。
5.根据权利要求3所述副溶血弧菌、美人鱼发光杆菌和鰤诺卡氏菌的检测试剂盒,其特征在于,所述蛋白酶K的浓度为20mg/mL,所述SDS溶液的质量浓度为10%。
6.根据权利要求3所述副溶血弧菌、美人鱼发光杆菌和鰤诺卡氏菌的检测试剂盒,其特征在于,所述PCRDsMix为2×PCRDsMix。
7.采用权利要求2~6任一所述检测试剂盒进行检测的方法,其特征在于,包括如下步骤:
1)取待检测样品50~100mg并加入500~550μL的TE缓冲液,用玻璃匀浆器充分匀浆后,于12000r/min离心10min;
2)步骤1)离心后去除沉淀,取上清备用;
3)向步骤2)上清溶液中加入30μL质量浓度为10%的SDS溶液和15μL20mg/mL的蛋白酶K,并于37℃温育1h;
4)向步骤3)温育后的溶液中加入100μL5mol/L的NaCl溶液,充分混匀后再加入80μLCTAB的NaCl溶液,65℃温育20min;
5)向步骤4)温育后的溶液中加入与温育后的溶液等体积的酚-氯仿-异戊醇混合溶液混匀,12000g/min离心4~5min;
6)将步骤5)离心后的上清转入一只新管中,加入上清液0.6~0.8倍体积的异丙醇,12000g/min离心4~5min;
7)步骤6)离心后去上清,沉淀用1mL的体积浓度为70%的乙醇洗涤后,12000g/min离心4~5min;
8)步骤7)离心后去上清,沉淀常温干燥5~10min,重溶于30~50μLTE缓冲液,即为样品DNA模板;
9)样品组三重PCR反应体系包括:12.5μL2×PCRDsMix、0.8μL引物V.pa-F、0.8μL引物V.pa-R、1.2μL引物N.se-F、1.2μL引物N.se-R、1.6μL引物P.da-F、1.6μL引物P.da-R、3μL步骤8)得到的样品DNA模板和2.3μL无菌水;
10)阳性对照组三重PCR反应体系包括:12.5μL2×PCRDsMix、0.8μL引物V.pa-F、0.8μL引物V.pa-R、1.2μL引物N.se-F、1.2μL引物N.se-R、1.6μL引物P.da-F、1.6μL引物P.da-R、3μL阳性对照品和2.3μL无菌水;
11)将步骤9)制得的样品组和步骤10)制得的阳性对照组分别混匀后12000g/min离心10s,置于PCR仪中,分别于94℃预变性5min,94℃变性30s、55℃退火30s、72℃延伸1min,35个循环,72℃延伸10min,进行PCR反应;
12)对步骤11)PCR反应结果进行电泳检测,分别设置样品孔、阳性对照孔和参比孔;所述样品孔取步骤11)样品组PCR反应产物5μL与6×LoadingBuffer1μL混合,加入到1%琼脂糖凝胶点样孔中;所述阳性对照孔取步骤11)阳性对照组PCR反应产物5μL与6×LoadingBuffer1μL混合,加入到1%琼脂糖凝胶点样孔中;所述参比孔取5μLDL2000DNAMarker加入到1%琼脂糖凝胶点样孔中;以140V电压分别对所述样品孔、所述阳性对照孔和所述参比孔进行电泳20min后,于凝胶成像系统下观察结果;若样品孔电泳条带出现与阳性对照孔相同大小的条带,则说明待测样品中含有相对应的细菌。
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