[发明专利]CYP3A5基因的检测引物组、其构成的反应体系及应用有效
申请号: | 201510784899.5 | 申请日: | 2015-11-16 |
公开(公告)号: | CN105602947B | 公开(公告)日: | 2019-01-11 |
发明(设计)人: | 张井存;汪大为 | 申请(专利权)人: | 北京晋祺生物科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/6883 |
代理公司: | 北京世誉鑫诚专利代理事务所(普通合伙) 11368 | 代理人: | 郭官厚 |
地址: | 100039 北京市海淀*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | cyp3a5 基因 检测 引物 构成 反应 体系 应用 | ||
1.一种CPY3A5基因的检测引物组,其特征在于,所述检测引物组如下:
正向外侧引物F3A:SEQ ID NO:1;
反向外侧引物B3A:SEQ ID NO:2;
正向内侧引物FIPA:SEQ ID NO:3;
反向内侧引物BIPA:SEQ ID NO:4;
正向外侧引物F3G:SEQ ID NO:5;
反向外侧引物B3G:SEQ ID NO:6;
正向内侧引物FIPG:SEQ ID NO:7;
反向内侧引物BIPG:SEQ ID NO:8;
所述SEQ ID NO:1-4所示的序列是用于检测rs776746位点的A等位基因;
所述SEQ ID NO:5-8所示的序列是用于检测rs776746位点的G等位基因;
FIP包含了F1c和F2,BIP包含了B1c和B2;
以特异性要求最严格的F1c的5’端针对rs776746位点设计等位基因特异引物,分别检测rs776746的A等位基因和rs776746的G等位基因;
通过分别在FIPA和FIPG的5’端第三位引进额外突变。
2.一种检测CYP3A5基因的反应体系,其特征在于,所述反应体系包括权利要求1所述的引物组,反应缓冲液,dNTPs,羟基萘酚蓝,甜菜碱,Bst DNA聚合酶,待检样品基因组DNA和去离子水;
所述反应缓冲液包括Tris-HCl,KCl,(NH4)2SO4,MgSO4和Tween-20。
3.根据权利要求2所述的反应体系,其特征在于,所述Tris-HCl的浓度为10-30mM,KCl的浓度为10-60mM,(NH4)2SO4的浓度为5-13mM,MgSO4的浓度为2-8mM,Tween-20的体积分数为0.1-1%,dNTPs的浓度为1-2mM,羟基萘酚蓝的浓度为108-130μM,甜菜碱的浓度为0.1-1M。
4.根据权利要求3所述的反应体系,其特征在于,所述Tris-HCl的浓度为15-25mM,KCl的浓度为50-55mM,(NH4)2SO4的浓度为8-12mM,MgSO4的浓度为2-6mM,Tween-20的体积分数为0.1-1%,dNTPs的浓度为1.2-1.8mM,羟基萘酚蓝的浓度为115-123μM,甜菜碱的浓度为0.5-0.8M。
5.根据权利要求4所述的反应体系,其特征在于,所述Tris-HCl的浓度为20mM,KCl的浓度为50mM,(NH4)2SO4的浓度为10mM,MgSO4的浓度为4mM,Tween-20的体积分数为0.1%,dNTPs的浓度为1.4mM,羟基萘酚蓝的浓度为120μM,甜菜碱的浓度为0.8M。
6.根据权利要求2-5中任一项所述的反应体系,其特征在于,所述反应体系包括反应体系A和反应体系G,其中每个25μL反应体系含有以下组分:
缓冲液:
去离子水加至25μL。
7.一种检测CPY3A5基因的检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包含如权利要求2所述的反应体系。
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