[发明专利]纳米金修饰的石墨烯用于蛋白质N末端分离的方法有效
申请号: | 201510796026.6 | 申请日: | 2015-11-18 |
公开(公告)号: | CN105316381B | 公开(公告)日: | 2019-06-21 |
发明(设计)人: | 张祥民;李兰婷 | 申请(专利权)人: | 复旦大学 |
主分类号: | C12P21/06 | 分类号: | C12P21/06;C07K1/14;G01N27/64 |
代理公司: | 上海正旦专利代理有限公司 31200 | 代理人: | 陆飞;盛志范 |
地址: | 200433 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 纳米 修饰 石墨 用于 蛋白质 末端 分离 方法 | ||
本发明属于生物技术领域,具体为一种纳米金修饰的石墨烯用于蛋白质N末端分离的方法。本发明方法步骤为,首先合成纳米金修饰的石墨烯(G@PDA@Au),再对氨基封闭后的蛋白进行酶解,对酶解液进行巯基衍生后,利用G@PDA@Au对衍生上巯基的非N末端肽段进行去除,最后利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱进行蛋白质N末端的检测。本发明方法可以方便高效地去除非N末端肽段,提高蛋白质N末端肽段鉴定效果。
技术领域
本发明属于生物技术领域,具体涉及一种利用纳米金修饰的材料用于蛋白质N末端分离的方法。
背景技术
蛋白质N末端的氨基酸起点常与数据库中的起始位点不同。蛋白质在翻译和加工过程中,N端可能涉及到RNA的剪切,多种可选的翻译起点,信号肽的切割,以及各种化学层面的翻译后修饰等过程,而导致蛋白质N末端的复杂性。鉴定蛋白质N末端序列对于理解蛋白质的生物功能等具有重要意义。
目前,蛋白质N末端的方法主要基于正向富集和反向去除策略。正向富集策略的主要原理是先在蛋白质N末端引入特异性基团,经胰蛋白酶酶切后,蛋白变成肽段,再利用相应的材料对蛋白质N末端进行特异性地分离。反相去除策略主要原理是先在蛋白质层面进行所有的氨基全封闭,经过胰蛋白酶酶切后,蛋白变成肽段,再利用非N末端肽段上的游离氨基,结合氨基反应材料去除非N末端肽段,并对蛋白质N末端肽段进行分离富集。反相去除方法相较正向富集方法,有望富集到更多因化学修饰而导致游离氨基封闭的N末端,然而,去除材料的效率相对略有不足。因此,许多研究合成不同的可离去基团修饰的材料,包括三氟乙磺酸基材料等,利用氨基的亲核性对非N末端肽段进行去除。
为进一步提高非N末端肽段去除效率,需要探索更高效的去除材料。有文献表明,利用特劳特试剂(Traut’s Reagent)可以对氨基进行高效快速的巯基衍生,而同时,利用金和硫可以在温和的条件下形成牢固的金硫键。巯基衍生和金硫键形成均为加成反应,因此,体系中不会引入多余的盐类,减少除盐过程中样品损失,且不影响质谱的鉴定。若体系中的非N末端肽段可以得到高效的巯基衍生并被金修饰的材料分离,则可以实现蛋白质N末端的高效分离鉴定。
发明内容
本发明的目的在于提供一种纳米金修饰的石墨烯用于蛋白质N末端分离的方法。
本发明提供的纳米金修饰的石墨烯用于蛋白质N末端分离的方法,具体步骤为:
首先,合成纳米金修饰的石墨烯(G@PDA@Au);
然后,对蛋白上的所有游离氨基进行封闭,再对封闭蛋白进行溶液酶解;
然后,用特劳特试剂对非N末端肽段进行巯基衍生,加入纳米金修饰的石墨烯对含巯基的非N末端肽段进行分离富集;
最后,利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-ToF)进行蛋白质N末端的检测。
本发明中,所述合成纳米金修饰的石墨烯的具体步骤如下:
(1)取一定质量石墨烯分散在10 mM Tris-HCl中,再加入4-10重量的多巴胺,室温下搅拌4-12 h;
(2) 将多巴胺包覆的石墨烯(G@PDA)经离心后,用水和乙醇交替洗涤数次,再在真空下烘干4-16 h;
(3)取一定质量G@PDA分散在50-100 ml 水中,加入终浓度为0.1-0.5 mM无水合氯金酸,加热至85-90℃后,加入5-10 mM柠檬酸三钠,保持加热1小时以上(一般为1-2小时),经离心,用水和乙醇交替洗涤数次后,用真空干燥,得到纳米金修饰的石墨烯。
本发明中,所述对蛋白上的所有游离氨基进行封闭,再对封闭蛋白进行溶液酶解的具体步骤日下;
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