[发明专利]同时检测引起苹果牛眼果腐病的4种病原菌的实时荧光PCR引物探针组合及方法有效
申请号: | 201510796234.6 | 申请日: | 2015-11-18 |
公开(公告)号: | CN105331707B | 公开(公告)日: | 2018-10-23 |
发明(设计)人: | 王卫芳;林惠娇;胡学难;何日荣 | 申请(专利权)人: | 广东出入境检验检疫局检验检疫技术中心;中华人民共和国黄埔出入境检验检疫局 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/04;C12R1/645 |
代理公司: | 广州新诺专利商标事务所有限公司 44100 | 代理人: | 刘婉 |
地址: | 510623 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 同时 检测 引起 苹果 牛眼果腐病 病原菌 实时 荧光 pcr 引物 探针 组合 方法 | ||
1.一种同时检测引起苹果牛眼果腐病的4种病原菌的实时荧光PCR引物和探针的组合物,所述引物和探针的组合物包括:
Neo F:5′-CCCTCGGTGGGGCAAAG-3′;
Neo R:5′-CCAACTCGGCGGCTTCC-3′;
MAL-P:FAM-TCATCATCATTTTCATCATC-MGB;
PER-P:CY5-CGCGTATCGCAACATCATCATTTTCATCAT-BHQ2;
ALB-P:NED-AAGATGTTCAACCCCTCCCTCGCGTA-BHQ1;
KIE-P:HEX-TGACCACTTGATGATCTC-MGB;
其中,FAM、CY5、NED、HEX为荧光基团,MGB、BHQ1、BHQ2为猝灭基团。
2.用于实时荧光PCR检测引起苹果牛眼果腐病的4种病原菌的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒含有权利要求1所述的引物和探针的组合物。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括dNTPs、Taq DNA聚合酶、Mg2+、PCR反应缓冲液中的至少一种。
4.根据权利要求2或3所述的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括阳性对照。
5.一种同时检测引起苹果牛眼果腐病的4种病原菌的实时荧光PCR方法,包括以下步骤:
1)提取待检测样品中的DNA;
2)以步骤1)中提取的DNA为模板,采用引物和探针的组合物,进行实时荧光PCR扩增反应;
3)分析Ct值;
其中,所述引物和探针的组合物包括:
Neo F:5′-CCCTCGGTGGGGCAAAG-3′;
Neo R:5′-CCAACTCGGCGGCTTCC-3′;
MAL-P:FAM-TCATCATCATTTTCATCATC-MGB;
PER-P:CY5-CGCGTATCGCAACATCATCATTTTCATCAT-BHQ2;
ALB-P:NED-AAGATGTTCAACCCCTCCCTCGCGTA-BHQ1;
KIE-P:HEX-TGACCACTTGATGATCTC-MGB。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,实时荧光PCR反应体系以20 μL计为:
模板DNA 50 ng,
引物 每条引物的终浓度均为0.5 μmol/L,
探针 每条探针的终浓度均为0.25 μmol/L,
2×Thunderbird Probe qPCR Mix 10 μL,
ddH2O 补足至20 μL;
其中,2×Thunderbird Probe qPCR Mix内含DNA聚合酶、dNTPs、MgCl2、反应缓冲液、ROX。
7.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,实时荧光PCR反应条件为:95℃ 10分钟;94℃ 15秒, 60℃ 60秒,共40个循环,每个循环结束后在FAM、CY5、NED、HEX通道下检测荧光信号。
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