[发明专利]一种能使CTAB法提取到真菌高质量基因组DNA的方法有效
申请号: | 201510815533.X | 申请日: | 2015-11-23 |
公开(公告)号: | CN105255860B | 公开(公告)日: | 2018-08-10 |
发明(设计)人: | 童森淼;冯明光 | 申请(专利权)人: | 浙江大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 杭州浙科专利事务所(普通合伙) 33213 | 代理人: | 张晓红 |
地址: | 310027 浙江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 ctab 提取 真菌 质量 基因组 dna 方法 | ||
1.一种能使CTAB法提取到真菌高质量基因组DNA的方法,其特征在于用CTAB法提取DNA的接种时直接用保菌的含目的菌的细沙接种、和/或用配制的孢子悬液均匀涂板接种后再加入细沙培养、培养的菌丝在提取DNA磨样时加入细沙磨样,所有样品均需磨样至菌丝呈现丝滑状超细粉末时止;
CTAB法提取DNA的接种时用保菌的含目的菌的细沙直接接种包括以下步骤:
1)在SDAY平板上铺上一层灭菌后的玻璃纸,加入100-200 µL的0.02%吐温水,再用含保有目的菌的60-120目细沙0.1-0.4g接种至SDAY玻璃纸上用涂棒均匀涂板, 24-26ºC培养2-3天;
2)然后刮取玻璃纸上的菌丝放入-70℃冰箱预冷的研钵中,加液氮进行快速研磨2-8min至菌丝最终呈现丝滑状超细粉末时止,再按照CTAB法步骤操作,提取过程减少在空气中暴露,所有离心过程使用冷冻离心机在4℃下进行;
CTAB法提取DNA的孢子悬液涂板后添加细沙方式接种包括以下步骤:
1)用灭菌后的0.02%吐温水配制成1×107个/ml的孢子悬液,取100-200 µL悬液用涂棒均匀涂板接种于SDAY平板表面的玻璃纸上,再添加60-120目灭菌后的细沙0.1-0.4 g至接种的平板上,然后24-26℃培养2-3天;
2)然后刮取玻璃纸上的菌丝放入-70℃冰箱预冷的研钵中,加液氮进行快速研磨2-8min至菌丝最终呈现丝滑状超细粉末时止,再按照CTAB法步骤操作,提取过程应尽量减少在空气中暴露,所有离心过程使用冷冻离心机在4℃下离心;
CTAB法用培养的菌丝在提取DNA磨样时加入细沙磨样包括以下步骤:
1)用含目的菌的细沙和/或配制成的1×107个/ml的孢子悬液接种于SDAY平板表面的玻璃纸上,24-26℃培养2-3天;
2)然后刮取玻璃纸上的菌丝放入-70℃冰箱预冷的研钵中,加入60-120目的灭菌后的细沙0.1-0.4 g加液氮进行快速研磨2-8 min至菌丝最终呈现丝滑状超细粉末时止,再按照CTAB法步骤操作,提取过程减少在空气中暴露,所有离心过程使用冷冻离心机在3-5℃下离心;
所述丝滑状超细菌丝 粉末为600-1000目。
2.如权利要求1所述的一种能使CTAB法提取到真菌高质量基因组DNA的方法,其特征在于CTAB法提取DNA的接种时用保菌的含目的菌的细沙直接接种的步骤1)中:加入120-180 µL的0.02%吐温水,再加入80-100目含目的菌种的细沙0.2-0.3 g至SDAY玻璃纸上用涂棒涂板均匀,25℃培养2.5天;步骤2)中:研磨时间为3-7 min。
3.如权利要求1所述的一种能使CTAB法提取到真菌高质量基因组DNA的方法,其特征在于CTAB法提取DNA的孢子悬液涂板后添加细沙方式接种的步骤1)中:取120-160 µL 1×107个/ml孢子悬液涂板均匀后,再添加80-100目灭菌后的细沙0.2-0.3 g至平板上,25℃培养2.5天;步骤2)中:研磨时间为3-7 min。
4.如权利要求1所述的一种能使CTAB法提取到真菌高质量基因组DNA的方法,其特征在于CTAB法用培养的菌丝在提取DNA磨样时加入细沙磨样的步骤1)中:取120-180 µL孢子悬液直接用涂棒均匀涂板接种于SDAY平板表面的玻璃纸上,25℃培养2.5天;步骤2)中加入80-100目的灭菌后的细沙0.2-0.3 g加液氮进行快速研磨3-5 min至菌丝最终呈现丝滑状超细粉末时止。
5.如权利要求1所述的一种能使CTAB法提取到真菌高质量基因组DNA的方法,其特征在于所述的真菌为球孢白僵菌、绿僵菌或蛹虫草。
6.如权利要求2所述的一种能使CTAB法提取到真菌高质量基因组DNA的方法,其特征在于步骤2)中:研磨时间为优选为4-6 min。
7.如权利要求3所述的一种能使CTAB法提取到真菌高质量基因组DNA的方法,其特征在于步骤2)中:研磨时间为4-6 min。
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