[发明专利]检测中枢神经系统真菌性感染者脑脊液中病原菌的基因芯片及试剂盒在审
申请号: | 201510849990.0 | 申请日: | 2015-11-27 |
公开(公告)号: | CN105331718A | 公开(公告)日: | 2016-02-17 |
发明(设计)人: | 王培昌;曹敬荣 | 申请(专利权)人: | 首都医科大学宣武医院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04 |
代理公司: | 北京爱普纳杰专利代理事务所(特殊普通合伙) 11419 | 代理人: | 何自刚 |
地址: | 100053 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 中枢神经系统 真菌 性感 脑脊液 病原菌 基因芯片 试剂盒 | ||
1.一种检测中枢神经系统真菌性感染者脑脊液中病原菌的基因芯片,包括固相载体和固定在该固相载体上的寡核苷酸探针,其特征在于:所述寡核苷酸探针包括在基质上设置的真菌28SrRNA通用探针和鉴定真菌的种特异性探针,所述鉴定真菌的种特异性探针为SEQIDNO:1-NO:4所示的碱基序列的DNA片段,所述真菌28SrRNA通用探针为SEQIDNO:5所示的碱基序列的DNA片段。
2.根据权利要求1所述的检测中枢神经系统真菌性感染者脑脊液中病原菌的基因芯片,其特征在于:上述鉴定真菌的种特异性探针5’端含有氨基修饰的聚dT串,所述氨基修饰的聚dT串为16聚的聚脱氧胸苷酸。
3.根据权利要求1所述的检测中枢神经系统真菌性感染者脑脊液中病原菌的基因芯片,其特征在于:该基因芯片还包括SEQIDNO:6所示的标记有生物素点的DNA序列。
4.根据权利要求1所述的检测中枢神经系统真菌性感染者脑脊液中病原菌的基因芯片,其特征在于:所述固相载体为修饰玻片或硅片。
5.一种用于检测中枢神经系统真菌性感染者脑脊液中病原菌的试剂盒,其特征在于包括如权利要求1所述基因芯片。
6.根据权利要求5所述的用于检测中枢神经系统真菌性感染者脑脊液中病原菌的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括SEQIDNO:7-NO:8所示的引物序列。
7.根据权利要求6所述的用于检测中枢神经系统真菌性感染者脑脊液中病原菌的试剂盒,其特征在于:所述引物的5’端带有标记基团,所述标记基团包括:地高辛分子、生物素分子、荧光素及其衍生物分子、Cy3,Cy5、碱性磷酸酶、辣根过氧化物酶。
8.一种检测中枢神经系统真菌性感染者脑脊液中病原菌的方法,不用于疾病的诊断和治疗,其特征在于:包括如下步骤:
(1)用常规方法制备模板DNA;
(2)用权利要求6所述引物序列将步骤(1)中制备的模板DNA通过PCR反应进行扩增,获得5’端带有标记基团DNA扩增产物;
(3)将步骤(2)中DNA扩增产物与杂交缓冲液混合;
(4)将步骤(3)中所得混合液与权利要求3所述的基因芯片上面分布的DNA探针、Bio进行杂交反应;
(5)完成步骤(4)杂交反应后,检测基因芯片的杂交信号,根据标记信号在基因芯片上的位置、强度等信息获取待测信息。
9.根据权利要求8所述的检测中枢神经系统真菌性感染者脑脊液中病原菌的方法,其特征在于:在所述步骤(4)前先将基因芯片与预杂交缓冲液进行预杂交。
10.根据权利要求8所述的检测中枢神经系统真菌性感染者脑脊液中病原菌的方法,其特征在于:所述步骤(2)中PCR反应的步骤,还包括:
1)94℃预变性5分钟;2)94℃变性45s;3)58℃退火45s;4)72℃延伸60s,重复2)-4)30次;5)最后72℃延伸7min的反应步骤。
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