[发明专利]一种鸭黄病毒核酸液相芯片的检测方法有效
申请号: | 201510901623.0 | 申请日: | 2015-12-08 |
公开(公告)号: | CN105331744B | 公开(公告)日: | 2019-01-22 |
发明(设计)人: | 徐彪;郑小龙;王群;孙明君;张晓文;孙涛;岳志芹 | 申请(专利权)人: | 山东出入境检验检疫局检验检疫技术中心 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6837;C12R1/93 |
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地址: | 266002 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鸭黄 病毒 核酸 芯片 检测 方法 | ||
1.鸭黄病毒核酸液相芯片检测方法,其特征在于,包括下列步骤:
(1)设计引物探针;
(2)RT-PCR反应体系的建立;
(3)液相芯片检测体系的建立;
设计的引物探针序列如下:
Primer1:DYF:5’-AGAATCCAGATGCCCAACCA-3’;
Primer2 :DYR:5’-Biotin-CACAATCCTGCCTTCTGCTTTC-3’;
Probe:DYProbe:5’-NH2(CH2)12-TCATAATCCCAAGGCAAC-3’;
RC-Probe:DY-RCProbe:5’-Biotin-GTTGCCTTGGGATTATGA-3’;
所述的RT-PCR反应体系的建立包括下列步骤:
采用RNA提取试剂盒进行RNA的提取;在0.2 mL PCR反应管中,依次加入10×RT-PCRbuffer, 2.5μL;各2.5 mmol/L 的dNTP ,2.0μL;10 pmol/μL 引物对, 各1μL;Inhibiter0.5μL;AMV XL 0.5μL;5 U/μL的AMV TaqμL,0.25μL;25 mmol/L MgCl2, 5.0μL;RNA 模板5.0μL;加入双蒸水7.25μL;使反应体积达到25μL;
在PCR仪上进行RT-PCR扩增,优化并确定RT-PCR工作程序:50℃ 30min;94℃ 2min;然后94℃ 30sec、58℃ 30sec、72℃ 30sec,30个循环;最后72℃延伸5min,4℃保温;
扩增产物用2%琼脂糖凝胶电泳,在紫外凝胶图像分析系统上观察、分析扩增产物;
所述的液相芯片检测体系的建立,包括下列步骤:
(1)寡核苷酸探针与微球共价偶联
①将微球漩涡混合20s充分分散;取75μL 的3×106个微球,于1.5ml离心管中10000g离心1min,去上清;
②加入50μL pH4.5的 0.1mol/L甲基咪唑溶液,漩涡混合,超声波处理0.5-1min;
③加入氨基化探针1.0nmol,漩涡混合;
④加入2.5μL碳二亚胺溶液充分混匀,室温避光孵育30min;碳二亚胺溶液的配置方法是10mg的碳二亚胺粉末加入1.0mL的灭菌纯水;
重复④一次;
加入1.0ml 0.02% Tween-20,混匀,10000g离心1min,弃上清;
加入1.0ml 0.1% SDS,混匀,10000g离心1min,弃上清;
用pH4.5的0.1mol/L甲基咪唑溶液100μL 重悬微球,2-8℃避光保存,待用;
(2)杂交
杂交体系包括1.5μL探针偶联微球,33μL 1.5×TMAC 杂交液,14.5μL TE,2.5μL RT-PCR产物;混合均匀后于98℃变性10min,孵育15min,18000g离心2min 去上清;加入50 μL用1×TMAC 杂交液稀释500倍的并经过PE标记的链亲合素,52下℃孵育10-15min,18000g离心2min 去上清;加入50 μL 1×TMAC 杂交液,漩涡混合使微球重悬,上机分析。
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