[发明专利]一种DNA测序的图像的磁珠提取方法及装置有效
申请号: | 201510909565.6 | 申请日: | 2015-12-10 |
公开(公告)号: | CN105447876B | 公开(公告)日: | 2017-02-15 |
发明(设计)人: | 刘元杰;陈哲;张睿;范东雨;高科;王者馥;王绪敏;殷金龙;任鲁风 | 申请(专利权)人: | 北京中科紫鑫科技有限责任公司 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06T7/30;G06T7/10 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 101111 北京市大兴区经济技术*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 dna 图像 提取 方法 装置 | ||
1.一种DNA测序的图像的磁珠提取方法,其特征在于,包括:
获取图谱信息,在对每个图谱的采样时间间隔内分别获取DNA图谱;
获取所述DNA图谱的第一像素和第二像素,其中,第一像素A为目标像素,第一像素的灰度值大于或等于初始分割阈值T0,像素总数为N;第二像素B为背景像素,第二像素的灰度值小于初始分割阈值T0,像素总数为M;图谱f(i,j)的最大值为Vmax,最小值为Vmin
其中,T0=1/2(Vmin+Vmax)(1);
计算第一像素和第二像素的灰度均值的全局阈值T;
计算第一像素和第二像素的方差σ2
σ2=(PA+PB)(T-T0)2(3);
其中,第一像素的概率为:
第二像素的概率为:
若方差在预设范围内,则以T为全局阈值对所述图谱进行分割;
获取CY3、CY5、FAM和TXR四种荧光图像;
分别在所述四种荧光图像中,通过计算磁珠上九个像素的灰度均值提取荧光强度信号;
通过所述荧光强度信号查找磁珠中心点;
对所述中心点进行融合处理,以获得融合后的磁珠中心点。
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