[发明专利]一种DNA测序的图像的磁珠提取方法及装置有效

专利信息
申请号: 201510909565.6 申请日: 2015-12-10
公开(公告)号: CN105447876B 公开(公告)日: 2017-02-15
发明(设计)人: 刘元杰;陈哲;张睿;范东雨;高科;王者馥;王绪敏;殷金龙;任鲁风 申请(专利权)人: 北京中科紫鑫科技有限责任公司
主分类号: G06T7/00 分类号: G06T7/00;G06T7/30;G06T7/10
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摘要:
搜索关键词: 一种 dna 图像 提取 方法 装置
【说明书】:

技术领域

发明涉及DNA测序分析领域,尤其涉及一种DNA测序的图像的磁珠提取方法及装置。

背景技术

在DNA测序技术领域,整体操作流程描述如下:DNA样品通过破碎后,应用建库试剂进行加接头、单链捕获、结合至微球、微乳液PCR扩增、破乳液,获得建立在微球上的DNA文库,应用加样板将文库和测序反应需要的酶等铺放至具有微反应池的测序芯片,测序芯片和测序试剂安装至主机上,通过控制计算机根据模块数量和位置启动测序程序,自动化进行测序反应,产生的数据传输至数据分析计算机,完成测序后应用计算分析软件进行图像处理、序列读出、质量分析、序列拼接等工作,最终得到DNA样本的序列信息。微反应池测序芯片是测序反应的载体,载有测序模板的DNABeads及各种测序反应用酶均位于刻有微反应池的测序芯片中。

在对反应芯片的图像采集、识别后,对图像磁珠提取的精确性严重影响对碱基类型的判定。

鉴于上述缺陷,本发明创作者经过长时间的研究和实践终于获得了本创作。

发明内容

本发明的目的在于提供一种DNA测序的图像的磁珠提取方法及装置,用以克服上述技术缺陷。

为实现上述目的,本发明提供一种DNA测序的图像的磁珠提取方法,包括:

获取图谱信息,在对每个图谱的采样时间间隔内分别获取DNA图谱;

获取所述DNA图谱的第一像素和第二像素,其中,第一像素A为目标像素,第一像素的灰度值大于或等于初始分割阈值T0,像素总数为N;第二像素B为背景像素,第二像素的灰度值小于初始分割阈值T0,像素总数为M;图谱f(i,j)的最大值为Vmax,最小值为Vmin

其中,T0=1/2(Vmin+Vmax)(1);

计算第一像素和第二像素的灰度均值的全局阈值T;

T=1/2(Σf(i,j)T0f(i,j)N+Σf(i,j)<T0f(i,j)M)---(2);]]>

计算第一像素和第二像素的方差σ2

σ2=(PA+PB)(T-T0)2(3);

其中,第一像素的概率为:

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