[发明专利]三峡库区沿江口岸4种鼠类cytB特异序列及分子鉴定方法在审
申请号: | 201510909675.2 | 申请日: | 2015-12-09 |
公开(公告)号: | CN105385699A | 公开(公告)日: | 2016-03-09 |
发明(设计)人: | 张华荣;文海燕;骆星丹;王董;彭彦卿;郝玉通;刘启军;陈正明 | 申请(专利权)人: | 重庆国际旅行卫生保健中心 |
主分类号: | C12N15/53 | 分类号: | C12N15/53;C12Q1/68 |
代理公司: | 重庆市恒信知识产权代理有限公司 50102 | 代理人: | 刘小红;李金蓉 |
地址: | 401147 *** | 国省代码: | 重庆;85 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 三峡 库区 沿江 口岸 鼠类 cytb 特异 序列 分子 鉴定 方法 | ||
1.三峡库区沿江口岸4种鼠类cytB特异序列,其特征在于:包括DNA序列为SEQIDNO.1的黄胸鼠cytB基因序列;DNA序列为SEQIDNO.2的小家鼠cytB基因序列;DNA序列为SEQIDNO.3的褐家鼠cytB基因序列;DNA序列为SEQIDNO.4的黑线姬鼠cytB基因序列。
2.权利要求1所述基因序列在使用分子鉴定方法鉴定黄胸鼠、小家鼠、褐家鼠以及黑线姬鼠中的应用。
3.根据权利要求2所述鉴定黄胸鼠、小家鼠、褐家鼠以及黑线姬鼠的分子鉴定方法,其特征在于包括以下步骤:
(1)DNA模板的制备按照DNeasyBlood&Tissue试剂盒使用说明书提取待测标本的肝脏、肌肉、皮毛或骨骼DNA,获取模板DNA;或者采用酚-氯仿抽提法提取待测标本的肝脏、肌肉、皮毛或骨骼DNA,获取模板DNA;
(2)PCR扩增PCR反应扩增体积为25μL,其中10×缓冲液2.5μL,10mmol/LdNTP2μL,25μmol/L的DNA序列为SEQIDNO.5的正向引物和DNA序列为SEQIDNO.6的反向引物各1μL,5U/μLTaq酶0.2μL,模板DNA2μL,ddH2O16.3μL;
PCR反应条件为:95℃预变性5min,94℃变性30s,55℃退火60s,72℃延伸60s,35个循环,最后再72℃延伸10min;
(3)PCR产物检测取5μLPCR扩增产物,用1%琼脂糖凝胶电泳,120V电压,电泳30min,溴化乙锭或Goldview核酸染料染色,荧光成像系统检测,取电泳效果较好的PCR扩增产物送由生物公司纯化后测序;
(4)序列分析将步骤(3)测得的序列与DNA序列为SEQIDNO.1的黄胸鼠cytB基因序列,DNA序列为SEQIDNO.2的小家鼠cytB基因序列,DNA序列为SEQIDNO.3的褐家鼠cytB基因序列和DNA序列为SEQIDNO.4的黑线姬鼠cytB基因序列,进行对比分析,判断待测标本的种属情况。
4.根据权利要求3所述鉴定黄胸鼠、小家鼠、褐家鼠以及黑线姬鼠的分子鉴定方法,其特征在于:所述酚-氯仿抽提法提取待测标本的肝脏、肌肉、皮毛或骨骼DNA的具体过程为:液氮速冻肝脏、肌肉、皮毛或骨骼样本并研磨,转移至10mL的离心管,加入DNA提取液,混匀,冰上放置;加入等体积的酚:氯仿:异戊醇=25:24:1,涡旋5min;8000rpm,4℃,5min离心,取上清液,再加入等体积的氯仿:异戊醇=24:1抽提;重复加入等体积的氯仿:异戊醇=24:1抽提,取上清液至新离心管中;加入所取上清液2.5倍体积无水乙醇,轻柔混匀,-20℃沉淀30min;10000rpm,4℃,离心10min收集沉淀;75%乙醇漂洗沉淀,空气干燥后,用ddH2O溶解沉淀,即得模板DNA。
5.根据权利要求4所述鉴定黄胸鼠、小家鼠、褐家鼠以及黑线姬鼠的分子鉴定方法,其特征在于:所述DNA提取液包括Tris-HCl400mMpH8.0;NaCl150mM;EDTA60mM;SodiumDodecylSulfate10g/L。
6.根据权利要求3所述鉴定黄胸鼠、小家鼠、褐家鼠以及黑线姬鼠的分子鉴定方法,其特征在于:步骤(3)所述测序所用引物为DNA序列为SEQIDNO.5的正向引物和DNA序列为SEQIDNO.6的反向引物。
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