[发明专利]CHO细胞基因拷贝数的微滴数字PCR定量检测方法在审
申请号: | 201510927246.8 | 申请日: | 2015-12-14 |
公开(公告)号: | CN105368957A | 公开(公告)日: | 2016-03-02 |
发明(设计)人: | 张朗;董烨平;李娟;乔君华;蔡洁行;周伟昌;陈智胜 | 申请(专利权)人: | 无锡药明康德生物技术股份有限公司;上海药明生物技术有限公司;天津药明康德新药开发有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 上海浦一知识产权代理有限公司 31211 | 代理人: | 丁纪铁 |
地址: | 214092 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | cho 细胞 基因 拷贝 数字 pcr 定量 检测 方法 | ||
1.CHO细胞基因拷贝数的微滴数字PCR定量检测方法,其特征在于,步骤包括:
1)提取CHO细胞基因组DNA;
2)用限制性内切酶对步骤1)提取的基因组DNA进行酶切处理;
3)进行微滴数字PCR反应;
4)PCR反应结束后,测定PCR反应板每孔样品的阳性微滴、阴性微滴数目,获得CHO细 胞的基因拷贝数。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤1),使用DNeasyBlood&TissueKit 提取基因组DNA。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤2),所述限制性内切酶为MseI。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,步骤2),酶切体系为:10×酶切缓冲液 10μl,限制性内切酶25U,25ng/μl的基因组DNA2.5μg,补双蒸水至100μl。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤3),PCR反应体系为:2×ddPCRSuperMix 12.5μl,90μM目的基因正向引物0.5μl,90μM目的基因反向引物0.5μl,90μM参照基 因正向引物0.5μl,90μM参照基因反向引物0.5μl,100μM目的基因探针0.05μl,100μM 参照基因探针0.05μl,基因组模板2μl,双蒸水8.4μl,总体积25μl。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,步骤3),所述目的基因包括重链基因和 轻链基因;所述重链基因的正向引物的序列如SEQIDNo.12所示,反向引物的序列如SEQID No.13所示,探针的序列如SEQIDNo.14所示;所述轻链基因的正向引物的序列如SEQIDNo.15 所示,反向引物的序列如SEQIDNo.16所示,探针的序列如SEQIDNo.17所示;所述参照 基因为B2M基因,该参照基因的正向引物的序列如SEQIDNo.3所示,反向引物的序列如SEQ IDNo.4所示,探针的序列如SEQIDNo.5所示。
7.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤3),PCR反应条件为:95℃,2min; 94℃,30s,60℃,1min,共40个循环;98℃,10min。
8.用于权利要求1所述方法的引物组,其特征在于,包括:重链基因的正向引物、重链 基因的反向引物、轻链基因的正向引物、轻链基因的反向引物、参照基因的正向引物、参照 基因的反向引物;所述重链基因的正向引物的序列如SEQIDNo.12所示,反向引物的序列如 SEQIDNo.13所示;所述轻链基因的正向引物的序列如SEQIDNo.15所示,反向引物的序 列如SEQIDNo.16所示;所述参照基因的正向引物的序列如SEQIDNo.3所示,反向引物的 序列如SEQIDNo.4所示。
9.用于权利要求1所述方法的探针组,其特征在于,包括重链基因的探针、轻链基因的 探针和参照基因的探针;所述重链基因的探针的序列如SEQIDNo.14所示;所述轻链基因的 探针的序列如SEQIDNo.17所示;所述参照基因的探针的序列如SEQIDNo.5所示。
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