[发明专利]采用兼并引物复合扩增21个短串联重复序列的试剂盒在审

专利信息
申请号: 201510930454.3 申请日: 2015-12-15
公开(公告)号: CN105368958A 公开(公告)日: 2016-03-02
发明(设计)人: 张威;张琰 申请(专利权)人: 基点认知技术(北京)有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 100191 北京市*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 采用 兼并 引物 复合 扩增 21 串联 重复 序列 试剂盒
【权利要求书】:

1.一种同时分析多个STR基因座的复合扩增系统,其特征在于:

在一个复合扩增反应体系中同时扩增21个基因座:Amelogenin、vWA、D21S11、D18S51、D5S818、D7S820、D13S317、D16S539、FGA、D2S1338、D19S433、D6S1043、D12S391、D8S1179、D3S1358、D1S1656、CSF1PO、PentaD、PentaE、TH01和TPOX;

所述的基因座分为下述四组,每组分别由不同荧光素标记:

第一组为D19S433、TH01、D21S11、D18S51和PentaE;

第二组为D3S1358、D13S317、D7S820、D5S818、CSF1PO和PentaD;

第三组为Amelogenin、vWA、D8S1179、TPOX、D6S1043和D1S1656;

第四组为D16S539、D12S391、D2S1338、FGA;

针对上述分组在基因座重复序列的侧翼分别设计特异性引物所述,使得基因座组内各个片段峰值均衡性达到40%以上,引物分为如下组合:

引物第一组为SEQIDNO:1-10;

引物第二组为SEQIDNO:11-22;

引物第三组为SEQIDNO:23-34;

引物第四组为SEQIDNO:35-42;

将上述四组基因座复合扩增,根据产物峰高情况调整各基因座引物浓度,使各基因座峰值整体均衡性达到30%以上。

2.根据权利要求1所述的复合扩增系统,其特征在于,其中基因座被位于该基因座两侧的一对引物扩增,其中每对引物中有一个引物的5’端进行荧光素标记。

3.根据权利要求1所述的复合扩增系统,其特征在于,该复合扩增系统的每个25ul扩增体系包括5ul上述引物混合物、10ul反应缓冲液和2U~4U的热启动TaqDNA聚合酶。

4.根据权利要求1所述的复合扩增系统,其特征在于,采用以下程序进行:

1)制作模板DNA;

2)聚合酶链式反应(PCR)扩增,

每25ul扩增体系配成混合液,混匀后分装至PCR反应管中,将2.5ul模板DNA加入PCR反应管中;

按照下面的反应条件设置热循环仪,将PCR反应管放入热循环仪中开始扩增基因片段,95℃保温5分钟;94℃保温30秒钟,60℃保温40秒钟,70℃保温50秒钟,运行30个循环;60℃保温30分钟;4℃持续保温直至取出样品;

3)电泳、检测

取0.5ul分子量内标和10ul去离子甲酰胺,乘以样品数,配成混合液;

以每管10ul混合液加入1ul扩增产物和等位基因阶梯,离心将液体收集到离心管的底部;

样品95℃变性4分钟,然后迅速冰上冷却4分钟,使DNA完全变性并保持变性状态;

将样品放在基因分析仪中开始电泳检测;

电泳结束,分析实验数据得到图谱和基因分型结果。

5.一种如权利要求1所述的复合扩增系统的对应基因座分组的SEQIDNO:1-42所示的用于复合扩增体系的引物序列或所述引物序列的混合物。

6.一种应用权利要求1所述复合扩增系统的21个短串联重复序列的复合扩增试剂盒,所述基因座为Amelogenin、vWA、D21S11、D18S51、D5S818、D7S820、D13S317、D16S539、FGA、D2S1338、D19S433、D6S1043、D12S391、D8S1179、D3S1358、D1S1656、CSF1PO、PentaD、PentaE、TH01、TPOX。该试剂盒包含SEQIDNO:1-42所示的引物。

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