[发明专利]一种BRAF V600E基因的检测引物组、其构成的反应体系及应用在审
申请号: | 201510944763.6 | 申请日: | 2015-12-16 |
公开(公告)号: | CN105463087A | 公开(公告)日: | 2016-04-06 |
发明(设计)人: | 张井存;汪大为 | 申请(专利权)人: | 北京晋祺生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京世誉鑫诚专利代理事务所(普通合伙) 11368 | 代理人: | 郭官厚 |
地址: | 100039 北京市海淀*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 braf v600e 基因 检测 引物 构成 反应 体系 应用 | ||
1.一种BRAFV600E基因的检测引物组,其特征在于,所述检测引物组如下:
正向外侧引物F3:SEQIDNO:1;
反向外侧引物B3:SEQIDNO:2;
正向内侧引物FIP:SEQIDNO:3;
反向内侧引物BIP:SEQIDNO:4。
2.根据权利要求1所述的检测引物组,其特征在于,所述SEQIDNO:3所示的序列是用 于检测BRAFV600E突变的特异性引物。
3.一种检测BRAF基因的反应体系,其特征在于,所述反应体系包括权利要求1或2所述 的引物组,反应缓冲液,dNTPs,羟基萘酚蓝,甜菜碱,BstDNA聚合酶,待检样品基因组DNA和 去离子水。
4.根据权利要求3所述的反应体系,其特征在于,所述反应缓冲液包括Tris-HCl,KCl, (NH4)2SO4,MgSO4和Tween-20;
优选地,所述Tris-HCl的浓度为10-30mM,优选为15-25mM,进一步优选为20mM;
优选地,所述KCl的浓度为10-60mM,优选为50-55mM,进一步优选为50mM;
优选地,所述(NH4)2SO4的浓度为5-13mM,优选为8-12mM,进一步优选为10mM;
优选地,所述MgSO4的浓度为2-8mM,优选为2-6mM,进一步优选为4mM;
优选地,所述Tween-20的体积分数为0.1-1%,优选为0.1%。
5.根据权利要求3或4所述的反应体系,其特征在于,所述dNTPs的浓度为1-2mM,优选为 1.2-1.8mM,进一步优选为1.4mM;
优选地,所述羟基萘酚蓝的浓度为108-130μM,优选为115-123μM,进一步优选为120μM;
优选地,所述甜菜碱的浓度为0.1-1.2M,优选为0.5-1M,进一步优选为1M。
6.根据权利要求3-5中任一项所述的反应体系,其特征在于,所述反应体系中每25μL反 应体系含有以下组分:
缓冲液:
7.一种如根据权利要求3-6中任一项所述的反应体系的使用方法,其特征在于,所述方 法包括如下步骤:
将反应体系所需各组分混合完毕,放置于恒温水浴锅进行反应,反应后升温进行灭活 处理,再根据体系颜色变化判定结果。
8.根据权利要求7所述的使用方法,其特征在于,所述恒温水浴锅的温度为55-70℃,优 选为60-68℃,进一步优选为63℃;
优选地,所述反应时间为15-90min,优选为45-80min,进一步优选为60min;
优选地,所述升温后的温度为78-90℃,优选为80-85℃,进一步优选为80℃;
优选地,所述升温后的反应时间为15-30min,优选为18-26min,进一步优选为20min。
9.根据权利要求7或8所述的使用方法,其特征在于,所述根据体系颜色变化判定结果 为:
反应体系为紫罗兰,则待测样本不携带BRAFV600E突变;
反应体系为天蓝色,则待测样本携带BRAFV600E突变。
10.一种检测BRAF基因的检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包含如权利要求3所述 的反应体系。
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