[发明专利]一种紫花肾茶的分子鉴定方法有效
申请号: | 201510955841.2 | 申请日: | 2015-12-17 |
公开(公告)号: | CN105483223B | 公开(公告)日: | 2020-07-24 |
发明(设计)人: | 杨春勇;李戈;王艳芳;唐玲;李荣英;马小军;张丽霞 | 申请(专利权)人: | 中国医学科学院药用植物研究所云南分所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895 |
代理公司: | 北京慕达星云知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11465 | 代理人: | 李冉 |
地址: | 666100 云南省西双*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 紫花 分子 鉴定 方法 | ||
1.一种紫花肾茶的分子鉴定方法,其特征在于按以下步骤进行:
1)取样及样品处理:采用正常生长肾茶,分别将紫花肾茶和白花肾茶的新鲜幼叶放入冰盒,置于-80℃超低温冰箱中储存24h,在低温条件下研磨成粉末状;
2)DNA提取及其纯度和浓度检测:取0.2g幼叶干粉,采用CTAB法提取总DNA,使用1.0%质量浓度琼脂糖凝胶电泳对所得基因组DNA的纯度进行检测,利用蛋白核酸定量测定仪检测DNA浓度;
3)引物筛选和PCR扩增:在对紫花肾茶进行SRAP分析的PCR扩增体系优化后,选取紫花肾茶和白花肾茶进行SRAP引物筛选,筛选出引物组合CS1和CS2,在PCR仪上进行DNA扩增,所述CS1引物为:正向引物序列为:TGAGTCCAAACCGGATA,如SEQ ID NO.1所示;反向引物序列为:GACTGCGTACGAATTTGA,如SEQ ID NO.2所示;所述CS2引物为:正向引物序列:TGAGTCCAAACCGGAAT,如SEQ ID NO.3所示;反向引物序列:GACTGCGTACGAATTTGC,如SEQ IDNO.4所示;
4)PCR扩增产物检测:扩增产物用测序仪进行毛细管电泳,电泳时间60min,电压为15000V,用GeneMapper 3.2软件分析获得电泳图谱文件;
5)电泳图谱比较:将待鉴定的肾茶按照步骤1)-4)的操作顺序及方法进行分析,得到待鉴定的肾茶SRAP电泳图谱,将此SRAP图谱与步骤4)获得的电泳图谱文件进行比较判定,判断其是否为紫花肾茶。
2.根据权利要求1所述的一种紫花肾茶的分子鉴定方法,其特征在于:采用CTAB法提取总DNA的具体过程包括:
(1)取6mL预热到65℃的2×CTAB溶液于装有叶片粉末的离心管中,65℃水浴20分钟,期间取出混合3至5次,使粉末和溶液充分混匀;
(2)取出离心管,待冷却至室温后,加入6mL氯仿-异戊醇,且氯仿与异戊醇的体积比为24:1,置于摇床上充分混匀5分钟;
(3)室温12000rpm离心10分钟;
(4)将上清液转入新的离心管中,加入2倍体积-20℃预冷无水乙醇,混匀,在-20℃冰箱中静置5分钟;
(5)室温12000rpm离心10分钟;
(6)弃上清液,DNA沉淀风干后,溶解于800μL去离子水中,作为PCR的模板DNA,-20℃保存备用。
3.根据权利要求1或2所述的一种紫花肾茶的分子鉴定方法,其特征在于:所述的DNA浓度大于10mg/mL,OD260/280的比值在1.8-2.0之间,OD260/230的比值在2.0-2.5之间。
4.根据权利要求1所述的一种紫花肾茶的分子鉴定方法,其特征在于:所述的PCR扩增的反应程序为:首先94℃预变性5min;其次94℃变性1min,35℃复性1min,72℃延伸1min,5个循环;然后94℃变性1min,50℃复性1min,72℃延伸1min,35个循环;最后72℃后延伸10min。
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