[发明专利]利用重组载体在丝状真菌中筛选外源基因的方法有效

专利信息
申请号: 201510991914.3 申请日: 2015-12-28
公开(公告)号: CN105463009B 公开(公告)日: 2019-03-22
发明(设计)人: 张东远;王国坤;张运鹏 申请(专利权)人: 中国科学院天津工业生物技术研究所
主分类号: C12N15/80 分类号: C12N15/80;C12Q1/6888;C12Q1/6897;C12Q1/02;C12R1/885
代理公司: 北京远大卓悦知识产权代理事务所(普通合伙) 11369 代理人: 史霞
地址: 300308 *** 国省代码: 天津;12
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摘要:
搜索关键词: 利用 重组 载体 丝状 真菌 筛选 基因 方法
【权利要求书】:

1.利用重组载体在丝状真菌中快速筛选外源基因的方法,其特征在于,包括以下步骤:

步骤一、将不含外源基因的重组载体转入丝状真菌获得转化子Ⅰ;

步骤二、将所述转化子Ⅰ培养产孢,应用流式细胞仪分析转化子孢子Ⅰ和阴性对照组获得分析图Ⅰ和分析图Ⅱ,分析图Ⅰ中沿横坐标排布有孢子群Ⅰ和孢子群Ⅱ,根据分布在分析图Ⅰ右侧的孢子群Ⅱ的分布范围设定圈定门,在分析图Ⅱ中应用所述圈定门圈定孢子群Ⅲ;

步骤三、构建带有丝状真菌启动子、待测外源基因、荧光蛋白表达基因、和终止子的丝状真菌的转化子Ⅱ;以及

步骤四、重复步骤二,应用流式细胞仪分析转化子孢子Ⅱ获得分析图Ⅲ,应用所述圈定门在分析图Ⅲ中圈定范围,当落入所述圈定门内的孢子群Ⅳ中孢子数量超过孢子群Ⅲ中孢子数量时,判定所述待测外源基因成功表达,当落入圈定门内的孢子群Ⅳ中孢子数量低于孢子群Ⅲ中孢子数量时,判定所述待测外源基因没有成功表达;

其中,所述转化子孢子Ⅰ为实验组,所述阴性对照组为带有空载体的丝状真菌孢子,所述丝状真菌的转化子Ⅱ为待检测组。

2.如权利要求1所述的利用重组载体在丝状真菌中快速筛选外源基因的方法,其特征在于,重组载体,其包括启动子、外源基因、荧光蛋白和终止子,所述外源基因位于启动子的下游,位于终止子或荧光蛋白的上游;所述荧光蛋白位于所述启动子或外源基因的下游,位于所述终止子的上游,所述外源基因为脂酰辅酶A还原酶基因,所述启动子为翻译延伸因子1启动子和丙酮酸激酶启动子;所述终止子为内切葡聚糖苷酶I终止子和外切葡聚糖苷酶II终止子。

3.如权利要求1所述的利用重组载体在丝状真菌中快速筛选外源基因的方法,其特征在于,所述步骤二中圈定门的最小值为分析图Ⅰ中沿横坐标排布的孢子群Ⅰ和孢子群Ⅱ之间的接触处所对应的分析图Ⅰ中的横坐标值。

4.如权利要求1所述的利用重组载体在丝状真菌中快速筛选外源基因的方法,其特征在于,所述步骤二中应用流式细胞仪分析转化子孢子Ⅰ和丝状真菌孢子的具体方法为:设置流式细胞仪的样品压力为20000EPS,利用前向角散射光面积和宽度图,去除粘连和杂信号;荧光信号使用488nm激光激发,FL1通道分析。

5.如权利要求1所述的利用重组载体在丝状真菌中快速筛选外源基因的方法,其特征在于,所述转化子的构建方法具体为:

7.1)以丝状真菌的基因组DNA和含荧光蛋白表达基因的质粒为模板PCR扩增获得启动子基因片段、终止子片段和荧光蛋白表达基因片段;

7.2)将所述启动子基因片段、终止子片段和荧光蛋白表达基因片段克隆入载体制备成质粒;以及

7.3)制备丝状真菌原生质体,应用所述质粒转化原生质体获得所述转化子。

6.如权利要求1所述的利用重组载体在丝状真菌中快速筛选外源基因的方法,其特征在于,所述启动子为翻译延伸因子1启动子和丙酮酸激酶启动子;所述终止子为内切葡聚糖苷酶I终止子和外切葡聚糖苷酶II终止子。

7.如权利要求5所述的利用重组载体在丝状真菌中快速筛选外源基因的方法,其特征在于,所述步骤7.2)还包括:在重组酶的作用下,将PCR扩增得到的启动子、终止子片段和荧光蛋白表达基因片段组装成Ppki-gfp-Tcbh2、Ppki-hph-Tcbh2或Ptef1-gfp-Tegl1的结构克隆到pSIMPLE-19 EcoR V BAP载体上;以及将外源待测基因整合至上述载体gfp的上游位置。

8.如权利要求1所述的利用重组载体在丝状真菌中快速筛选外源基因的方法,其特征在于,将分析图Ⅲ中落入所述圈定门内的孢子群Ⅳ中孢子以单孔单孢的形式,分选到浅层黑色培养板中培养6天,酶标仪在入射光波长488nm,出射光波长530nm测定各转化子培养物的荧光值,其中,荧光值高于400的转化子培养物所对应的转化子为外源基因高表达的纯系转化子。

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