[发明专利]一种检测ITPA基因多态性的引物及其方法在审
申请号: | 201511009416.0 | 申请日: | 2015-12-30 |
公开(公告)号: | CN105506099A | 公开(公告)日: | 2016-04-20 |
发明(设计)人: | 燕启江;胡昌明;梁耀铭;于世辉;赵薇薇;郭周萍 | 申请(专利权)人: | 广州金域检测科技股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京精金石专利代理事务所(普通合伙) 11470 | 代理人: | 刘晔 |
地址: | 510000 广东省广州市国际生物岛*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 itpa 基因 多态性 引物 及其 方法 | ||
1.一种检测ITPA基因多态性的引物,其特征在于:包括PCR扩增引物和SNaPshotPCR引 物;所述PCR扩增引物为:针对ITPA的上游引物5’-GGAGATGGGCAGCAGAGTTA-3’和下游引物 5’-CAGGTCACAGGAAGACAGAGA-3’;所述SNaPshotPCR引物包括:针对ITPA0101的SNaPshot PCR引物5’-AAAAAAAAAAAAGATCGATCGAGAAATCCAACCATCTTTTAAAAA-3’,针对ITPA7354的 SNaPshotPCR引物5’-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATATTTTCTGTGCCACCAAAGTGCAT G-3’。
2.根据权利要求1所述的检测ITPA基因多态性的引物,其特征在于:所述SNaPshotPCR 引物中ITPA0101和ITPA7354的引物浓度比为1:1。
3.一种检测ITPA基因多态性的方法,其特征在于:包括如下步骤:
S1提取DNA样品;
S2以步骤S1提取的DNA样本为模板,采用权利要求1中所述的PCR扩增引物进行多重PCR 扩增,并对扩增产物进行纯化;
S3以步骤S2纯化后的PCR扩增产物为模板,采用权利要求1中所述的SNaPshotPCR引物 进行SNaPshotPCR扩增,并对SNaPshotPCR扩增产物进行纯化;
S4采用毛细管电泳技术进行检测,对检测结果进行分析,确定SNP位点及其基因型。
4.根据权利要求3所述的同时检测IL28B和ITPA基因多态性的方法,其特征在于:所述 步骤S1中的DNA样品为EDTA抗凝外周血的DNA样品。
5.根据权利要求3所述的检测ITPA基因多态性的方法,其特征在于:所述步骤S2中的多 重PCR扩增反应条件包括:阶段1:98℃3min;阶段2:98℃10s;阶段3:58℃30s;阶段4:72 ℃1min;阶段5:返回到阶段2,29个循环;阶段6:72℃5min;阶段7:25℃保温。
6.根据权利要求3所述的检测ITPA基因多态性的方法,其特征在于:所述步骤S3中的 SNaPshotPCR扩增反应条件包括:阶段1:96℃10s;阶段2:55℃5s;阶段3:60℃30s;阶段 4:返回到阶段1,25个循环;阶段5:4℃保温。
7.根据权利要求3所述的检测ITPA基因多态性的方法,其特征在于:所述步骤S4中采用 GENEMAPPERIDV4.1软件对检测结果进行分析。
8.根据权利要求1所述的检测ITPA基因多态性的引物在制备检测ITPA基因多态性试剂 中的用途。
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