[发明专利]一种副溶血弧菌氟喹诺酮类药物耐药基因检测方法在审
申请号: | 201511011330.1 | 申请日: | 2015-12-30 |
公开(公告)号: | CN105567813A | 公开(公告)日: | 2016-05-11 |
发明(设计)人: | 黄升谋 | 申请(专利权)人: | 湖北文理学院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/02 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 441053 湖北省襄樊市*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 溶血 弧菌 喹诺酮类 药物 耐药 基因 检测 方法 | ||
1.一种副溶血弧菌氟喹诺酮类药物耐药基因检测方法,其特征在于:包括如下步骤:
(1)收集副溶血弧菌活菌体1.0~1.2g,用7~8mL去离子水重悬,反复冻融破碎细胞,离心后收集上清液,得到模板;
(2)将该模板与氟喹诺酮类药物耐药基因检测引物GyrA-F、GyrA-R、GyrB-F、GyrB-R、ParE-F和ParE-R共同混合后,进行PCR扩增,该PCR扩增的反应体系中包括超纯水、PCR缓冲液、终浓度均为0.3~0.5mmol/L的dNTP、终浓度为0.3~0.5mmol/L的GyrA-F、终浓度为0.3~0.5mmol/L的GyrA-R、终浓度为0.5~0.8mmol/L的GyrB-F、终浓度为0.5~0.8mmol/L的GyrB-R、终浓度为0.5~0.6mmol/L的ParE-F、终浓度为0.5~0.6mmol/L的ParE-R和终浓度为0.02~0.03U/uL的TaqDNA聚合酶,其中GyrA-F、GyrA-R、GyrB-F、GyrB-R、ParE-F和ParE-R分别如SEQID1、SEQID2、SEQID3、SEQID4、SEQID5和SEQID6,上述PCR缓冲液的10倍母液中包括10~20mM氯化钾、pH8.3的12mMTris-HCl和0.01~0.02%氯化钠,20~30mMMgCl2;
(3)步骤(2)的PCR扩增结束后,进行琼脂糖凝胶电泳并送交测序。
2.如权利要求1所述的一种副溶血弧菌氟喹诺酮类药物耐药基因检测方法,其特征在于:所述步骤(1)为:收集副溶血弧菌活菌体1.0~1.2g,用7~8mL去离子水重悬,反复冻融破碎细胞,10000~12000rpm离心10~15min后收集上清液,得到模板。
3.如权利要求1所述的一种副溶血弧菌氟喹诺酮类药物耐药基因检测方法,其特征在于:所述PCR扩增的反应体系中包括超纯水、PCR缓冲液、终浓度均为0.4mmol/L的dNTP、终浓度为0.4mmol/L的GyrA-F、终浓度为0.4mmol/L的GyrA-R、终浓度为0.7mmol/L的GyrB-F、终浓度为0.7mmol/L的GyrB-R、终浓度为0.5mmol/L的ParE-F、终浓度为0.5mmol/L的ParE-R和终浓度为0.02U/uL的TaqDNA聚合酶。
4.如权利要求1所述的一种副溶血弧菌氟喹诺酮类药物耐药基因检测方法,其特征在于:所述PCR缓冲液的10倍母液中包括15mM氯化钾、pH8.3的12mMTris-HCl和0.01%氯化钠,30mMMgCl2。
5.如权利要求1至4中任一权利要求所述的一种副溶血弧菌氟喹诺酮类药物耐药基因检测方法,其特征在于:所述PCR扩增的反应条件如下:90~93℃预变性8~10min,然后进入如下循环:90~93℃变性40s~50s、50~53℃退火40~50s、72~74℃延伸50s~1min,共30~35个循环,循环结束后于72℃延伸5~10min,2~4℃保存。
6.如权利要求5所述的一种副溶血弧菌氟喹诺酮类药物耐药基因检测方法,其特征在于:所述PCR扩增的反应条件如下:93℃预变性10min,然后进入如下循环:93℃变性50s、53℃退火50s、72℃延伸1min,共35个循环,循环结束后于72℃延伸10min,4℃保存。
7.如权利要求1所述的一种副溶血弧菌氟喹诺酮类药物耐药基因检测方法,其特征在于:所述步骤(3)的电泳条件为:2%琼脂糖凝胶,80V电压,时间40min。
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