[发明专利]一种基于LEAP-2基因判断云南地方鸡抗病能力强弱的方法有效
申请号: | 201511017340.6 | 申请日: | 2015-12-29 |
公开(公告)号: | CN105483247A | 公开(公告)日: | 2016-04-13 |
发明(设计)人: | 刘丽仙;李琦华;荣华;赵筱;李正田;徐志强;谷大海;曹振辉;豆腾飞;佟荟全;林秋叶;贾俊静;汪善荣;葛长荣 | 申请(专利权)人: | 云南农业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京名华博信知识产权代理有限公司 11453 | 代理人: | 李中强 |
地址: | 650201 云南*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 leap 基因 判断 云南 地方 抗病 能力 强弱 方法 | ||
1.一种基于LEAP-2基因判断云南地方鸡抗病能力强弱的方法,其特征在于:具 体包括以下步骤:
1)RNA的提取
①选取同一批次出壳的云南地方鸡的健康鸡只120只进行隔离饲养,分别于 4、8、12周龄屠宰,采集各个鸡只的肝脏、脾脏、胸腺、法氏囊组织,将采集 的组织进行低温冷冻,将低温冻结的组织样品称量后转移至用液氮预冷的研钵 中,用研杵研磨组织,其间不断加入液氮,直至研磨成粉末状;加入RNAisoPlus;
②将匀浆液转移至离心管中;
③向匀浆裂解液中加入RNAisoPlus体积量1/5的氯仿,紧盖离心管盖, 混合至溶液乳化呈乳白色;
④室温静置5分钟;
⑤在4℃条件下离心15分钟,从离心机中取出离心管,此时匀浆液分为三 层,即:无色的含RNA上清液、中间的含DNA的白色蛋白层及带有颜色的下层 有机相;
⑥吸取上清液转移至另一个离心管中,向上清液中加入0.5-1倍RNAiso Plus体积的异丙醇,上下颠倒离心管充分混匀后,室温下静置10分钟;
⑦4℃条件下离心10分钟;
2)RNA沉淀的清洗
弃去上清液,加入与RNAisoPlus等量的75%乙醇,上下颠倒洗涤离心 管管壁,在4℃条件下离心5分钟后小心弃去上清液;
3)RNA的溶解
打开离心管盖,室温干燥沉淀,沉淀干燥后,加入RNase-free水溶解沉 淀,最后将RNA溶液贮存于-80℃;
4)总RNA纯度、浓度及完整性检测
取1μL总RNA溶于99μL无RNase水中,用蛋白质核酸检测仪测总RNA 在OD260nm、OD280nm的吸光值,并求出两者的的比值;
5)总RNA电泳检测
取3μL总RNA样品经1%琼脂糖凝胶电泳20min后,在凝胶紫外线投射仪 下观察电泳结果;
6)PCR引物设计
根据GenBanK中原鸡(Gallusgallus)的相关基因序列,使用引物设计软件 primer5.0设计引物,并合成,合成后进行荧光定量PCR;引物序列为F:5’ -GGCATTCCTTTTATTCTTCTCGC-3’;R:5’-TGCATTCACTGTTATCCCTACA-3’;
7)检测LEAP-2基因的表达量
检测云南四个地方鸡种肝脏、脾脏、胸腺、法氏囊四个组织中LEAP-2基因 的表达量,荧光定量PCR的反应条件为:95℃预变性2min;95℃变性15s,65℃ 退火30s、72℃延伸30s,40个循环。
2.根据权利1所述的一种基于LEAP-2基因判断云南地方鸡抗病能力强弱的方 法,其特征在于:在步骤1)总RNA的提取①中加入RNAisoPlus的量为1ml。
3.根据权利1所述的一种基于LEAP-2基因判断云南地方鸡抗病能力强弱的方 法,其特征在于:在步骤1)总RNA的提取③中加入RNAisoPlus体积量1/5 的氯仿。
4.根据权利1所述的一种基于LEAP-2基因判断云南地方鸡抗病能力强弱的方 法,其特征在于:在步骤1)总RNA的提取⑤中溶液分层为三层,三层分别为: 无色含RNA的上清液、白色的中间蛋白层及带有颜色的下层有机相。
5.根据权利1所述的一种基于LEAP-2基因判断云南地方鸡抗病能力强弱的方 法,其特征在于:步骤6)PCR引物设计中用于荧光定量的LEAP-2基因的引物 序列为:
F:5’-GGCATTCCTTTTATTCTTCTCGC-3’
R:5’-TGCATTCACTGTTATCCCTACA-3’
内参18SrRNA的引物序列为:
F:5’-TGGACTCCTACAACCAACGG-3’
R:5’-CATCCTCCTTGAACTCGCAG-3’
荧光定量PCR的反应条件为:95℃预变性2min;95℃变性15s,65℃退火 30s、72℃延伸30s,40个循环。
6.根据权利1所述的一种基于LEAP-2基因判断云南地方鸡抗病能力强弱的方 法,其特征在于:所述的云南地方鸡包括武定鸡、盐津乌骨鸡、茶花鸡、大围 山微型鸡。
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